第七章

1、诱导表达

诱导表达是指在特定环境因素刺激下，基因被激活，从而使基因的表达产物增加。有些基因表达极易受环境变化影响，属于可被调节的基因，在特定环境信号刺激下，有些基因的表达方面为开放或增强，如当DNA分子损伤后，细胞内与DNA损伤修复相关的蛋白质就会高表达。

2、负调控

负调控是指阻遏蛋白与操纵基因的结合，阻止RNA聚合酶对操纵子结构基因的转录。原核生物基因的表达一般受到蛋白质的抑制，其转录被降低。抑制作用是通过阻遏蛋白与操纵序列的结合实现的。阻遏蛋白与操纵序列的结合受一些小分子物质的调节。

3、操纵子

操纵子是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。很多功能上相关的基因前后相连成串，由一个共同的控制区进行转录的控制，包括结构基因以及调节基因的整个DNA序列。主要见于原核生物的转录调控，如乳糖操纵子、阿拉伯糖操纵子、组氨酸操纵子、色氨酸操纵子等.

4、前导肽

前导肽是指信号肽的一种，位于成熟蛋白的N端，引导蛋白穿膜，并且在后来被剪切掉。色氨酸操纵子RNA的前导序列中含有一个有效的核糖体结合位点，并能形成由前导RNA 27~68号碱基所编码的14个氨基酸的多肽，这一多肽被称为前导肽。前导肽的特点：①在其第10和11位上有相邻的两个色氨酸密码子。这些密码子参与了trp及其他操纵子中的转录弱化机制。②前导肽含有较多的碱性氨基酸、羟基氨基酸，并容易形成a-螺旋结构的能力，便于穿膜。③长约20~80个氨基酸，通常带正电荷的碱性氨基酸(Arg，lys)含量较丰富。④有形成两性α-螺旋的倾向。⑤需要受体从接触点进去，解折叠能量，需前导肽酶，需分子伴侣，不同的前导肽无同源性。

5、辅阻遏物

辅阻遏物是指在可阻遏系统中，能与阻遏蛋白结合导致该操纵子结构基因转录被阻遏的小分子物质。若是辅阻遏物钝化了无辅基诱导蛋白或是活化了无活性的阻遏蛋白，操纵子即转入被阻遏的状态。与一个基因的调控序列或操纵基因结合以阻止该基因转录。

6、cAMP受体蛋白（CRP）

CAMP受体蛋白(CRP)是指一种二聚体蛋白质，该蛋白质每个亚基含209个氨基酸残基，可起转录起始因子的作用，在有cAMP时，能使操纵子有效地进行转录。CRP上有重要的三个位点参与基因转录激活过程：与RNA pol的α亚基的羧基端结合区域(αCTD)、与α亚基的氨基端结合区域(αNTD)以及与s亚基结合区域。CRP以二聚体形式与DNA结合而发挥作用，二聚体可被单个cAMP激活，CRP单体包括一个DNA结合区和一个转录激活区。

7、魔斑

魔斑又称超级调控子，是指当细菌生长过程中，遇到氨基酸全面缺乏时，细菌将会产生一个应急反应，停止全部基因的表达。产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp)。ppGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子，而是影响一大批操纵子，所以称它们是超级调控子或称为魔斑。

8、结构基因

结构基因是指编码任何蛋白质或非调控因子的RNA的基因，是操纵子的一部分。它编码的内容呈现广泛的功能和结构，包括结构蛋白、酶类(如催化酶)或不执行调控功能的RNA分子。这些基因是细胞表现形态和功能特征所必需的。在真核细胞中，结构基因被内含子和外显子所分隔；而在原核细胞中则是连续的。与调控基因、编码启动子的基因不同，结构基因在蛋白质的翻译中起到实质性的作用。编码蛋白质(或酶)或RNA的基因。功能是把携带的遗传信息转录给mRNA，再以mRNA为模板合成具有特定氨基酸序列的蛋白质。

第八章

1、基因重排

基因重排指DNA分子的核苷酸序列重新排列，这些序列的重排可以产生新基因，也可以调节基因的表达。基因重排是一种重要的DNA断裂后修复机制，按修复的结果基因重排分为基因内重排和基因间重排。基因重排也被广泛应用于微生物的育种技术中，它可以使工程菌快速获得优良、多样的形状。

2、锌指结构

锌指结构是指含有较多的半胱氨酸(Cys)和组氨酸(His)的DNA结构区域中，由于肽链的弯曲使2个Cys和2个His与一个锌离子，或4个Cys与一个锌离子络合成的一个形似指状的三级结构。多个指结构常串联重复，具有很强的保守性。具有锌指结构的蛋白通常具有基因表达调控的功能。

3、受体

受体是指位于细胞膜或细胞内，能特异性识别生物活性分子并与之结合，进而引起生物学效应的特殊蛋白质。膜受体多为镶嵌糖蛋白，位于细胞膜上；而胞内受体全部为DNA结合蛋白，位于细胞浆和细胞核中。受体在细胞信息传递、药物、维生素及毒物等发挥生物学作用的过程中都起着极为重要的作用。

4、G蛋白

G蛋白又称三聚体GTP结合调节蛋白，是指由α、β、γ三个亚基组成，能与GDP或GTP结合的外周蛋白。以三聚体存在并与GDP结合者为非活化型，位于细胞膜。当α亚基与GTP结合并导致βγ二聚体脱落时则变成活化型，可作用于膜受体的不同激素，通过不同的G蛋白介导影响质膜上某些离子通道或酶的活性，继而影响细胞内第二信使浓度和后续的生物学效应。

5、cAMP依赖性蛋白激酶（PKA）

CAMP依赖性蛋白激酶(PKA)又称蛋白激酶A或A激酶，是指一种由两个催化亚基(C)和两个调节亚基(R)组成的四聚体。其活性受cAMP调控，每个R上有两个cAMP结合位点，当cAMP与R结合后，R脱落，游离的C使底物蛋白特定的丝/苏氨酸残基磷酸化。

6、第二信使

第二信使指在胞内产生的非蛋白类小分子，通过其浓度变化(增加或者减少)应答胞外信号与细胞表面受体的结合，调节胞内酶的活性和非酶蛋白的活性，从而在细胞信号转导途径中行使携带和放大信号的功能。如cAMP、cGMP、IP3、DAG、Ca2+等。

7、DNA甲基化

DNA甲基化是指DNA甲基转移酶催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体，将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应，是一种表观遗传修饰。在真核生物的DNA中，5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基，CG二核苷酸是最主要的甲基化位点。一般说来，DNA的甲基化会抑制基因的表达，DNA的甲基化对维持染色体的结构、X染色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起着重要的作用。

8、转录因子

转录因子是指在转录起始复合体的组装过程中，与启动子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质，是一种起正调控作用的反式作用因子，是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。根据作用特点可以将转录因子分为两类：普遍转录因子和组织细胞特异性转录因子。

9、结构域

结构域是指蛋白质中可以具有独立的超二级结构的部分，处于蛋白质的二级结构和三级结构之间，是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域。通常由一个基因外显子编码，并具有特定的功能，蛋白质中不同的结构域通常由不同的外显子编码。在较大的蛋白质中，多个结构域间可通过较短的多肽柔性区互相联接。

10、蛋白质磷酸化

蛋白质磷酸化是指由蛋白质激酶催化的把ATP或GTP上γ位的磷酸基转移到蛋白质氨基酸残基上的过程，为可逆过程，是生物体内存在的一种普遍的调节方式，在细胞信号的传递过程中占有极其重要的地位。蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍，也是最重要的机制。

11、RNA的组成型剪接（RNA constitutive splicing）

RNA的组成型剪接是指编码蛋白质的不连续基因通过RNA剪接将内含子从mRNA前体中依次除去，规范地将外显子剪接成成熟的mRNA的过程。RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程，通过RNA剪接，可以产生许多具有功能的，带有编码信息的mRNA，它对生物的发育及进化至关重要。

12、DNA酶Ⅰ超敏感位点 （DNaseⅠ hypersensitive site)

DNA酶|超敏感位是指由于对DNA酶|和其他核酸酶的切割高度敏感而被发现的染色体上的一小段区域。该区域可能不含有核小体致使DNA双螺旋裸露而产生，这种区域通常很短，最长也不过几百bp。由于该位点含有特异的DNA序列，为特异性DNA结合蛋白所识别，因此，它参与了基因表达的调控。

13、亮氨酸拉链（leucine zipper）

亮氨酸拉链是指反式作用因子的DNA结构域中含有一段约30个氨基酸组成的核心序列。N端富含碱性氨基酸，形成DNA结合面，其中每隔6个氨基酸残基就有规律地出现一个亮氨酸残基。这段序列在形成α螺旋后，螺旋的一侧以带电荷的氨基酸残基为主(如Arg、Asp)，具有亲水性；螺旋的另一侧是排列成行的亮氨酸，具有疏水性，即为亮氨酸拉链区。两个具有亮氨酸拉链区的反式作用因子通过疏水相互作用形成亮氨酸拉链。