Figure 1. homologs示意图

homology在生物学上被翻译成“同源性”，是指在不同生物类群中，由于共同的祖先，在一对结构或基因间表现出来的相似性。在基因序列(DNA,RNA or Protein)上体现出的相似性被称作序列同源性(sequence homology)，具有序列同源性的基因被称做同源基因(homolog=homologous gene)，常用于进化生物学的研究。

按不同成因分为两类（也有把homolog分为ortholog，paralog和xenolog三类的）：

Figure 2. ohnologs示意图

按照逻辑，应该有一套完整的单词：

但我查了下，paragroup,homogroup这两个词是不存在的。按照orthogrop的定义，个人觉得用homogroup代替orthogroup好像更好，因为直系同源群内包括orthologs和paralogs，即包括所有homologs。

Figure 3. analog示意图

异同源基因(xenolog)：水平基因转移(horizontal/lateral gene transfer)导致，来源于寄生，腐生，共生或病毒侵染等途径转移产生的异同源基因；一般具有相似功能，但如果新环境差异巨大，功能可能出现分化。xenolog一词最早在1970年由Walter Fitch创造。由于异同源基因不是来自共同祖先，而是拥有独立起源。

analog（不知道咋翻译，同功基因？）：在不同物种中，不相关的基因有着相似的功能，但是独立的进化起源。按照定义，xenolog应该是一种analog。

基因家族(gene family)：是指在一个物种中，起源于一个基因的复制，通常具有相似生化功能的一套基因。

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