牛顿是一位杰出的物理学家，但事实上他不是无神论者。牛顿一生写了许多书，其中近80%是宗教书籍，所以牛顿是一个彻头彻尾的有神论者。因为他相信上帝，牛顿致力于科学研究，以找出自然现象背后的原因。每次探索事物的规律，都试图接近上帝。在牛顿时代，他建立了牛顿的力学体系，但这与上帝并不矛盾。牛顿发现自然有自己的规律，反映了上帝对一切事物的精确控制。

牛顿的研究告诉我们宇宙是如此微妙，以至于它一定是上帝的意志。至于牛顿本人，他从未真正思考和质疑上帝创造万物的合理性。真正开始挑战上帝存在的科学家是拉普拉斯。当他把他的巨著《天体力学》献给拿破仑时，拿破仑发现他没有写任何赞美上帝创造万物的话。拿破仑质问他，他很自信的说，陛下，我不需要那个假设。

牛顿的信仰是时代的产物。随着科学技术的发展，宗教和科学的关系发生了很大的变化。宗教不再与科学联系在一起。宗教的创始人可以说是极其聪明的，他将当时的科学、哲学和其他领域的知识结合在一起，附着在上帝的光环上，并用模糊的语言向世界传播。它会使有神论者屈从于它，无神论者发现很难完全反驳它。然而，神学最终会被科学征服。

科学是严谨的，并且谈论证据。它不像神学那样抽象和流畅。再也很难说服人们以模糊的理由相信它。就像当人类用科学揭开日食的秘密时，没有人会相信天狗会再吃月亮，人类登上在月球后，也没有人会相信月亮上还有广寒宫。宗教最终将只会成为人们的心理安慰，永远不能凌驾于科学之上。随着细胞理论、能量和质量守恒、进化等现代科学的发展，宗教神学在自然规律中的主导地位已经被彻底打破。人们普遍认为科学技术是生产力，宗教可以继续保持在心理和社会层面。