清华大学化工科学与技术研究院成立于2001年4月30日。为发挥综合学科优势，促进清华大学在现代化工科技领域的研究，经2000－2001学年度第15次校务会议讨论通过建立了清华大学化工科学与技术研究院。该院面向全校组织化工领域的学科建设，建立化工科学与技术的科研平台和基地，开展前瞻性、交叉性、基础性和创新性的科研工作，培养高质量的研究生，并积极面向国民经济建设，努力承担和完成重大科研任务，发展自主知识产权，加强校内外、国内外学术交流和科技合作，为学校和国家的发展尽心竭力。首任院长由中国工程院院士金涌教授担任。