分析 基因突变是基因中碱基对的增添、缺失或替换而引起的基因结构的改变；染色体变异包括染色体数目改变和染色体结构改变．动物缺失一条染色体的个体叫做单体，因此从要遗传变异的角度看，属染色体数目变异．

解答 解：（1）正常果蝇的体细胞中含有4对8条染色体，共有2个染色体组．（2）有眼（E）和无眼（e）是由位于IV染色体上一对等位基因控制的．纯合的有眼果蝇与无眼果蝇杂交，后代出现一只无眼果蝇，由于IV号染色体少一条的个体称为IV-单体，能正常生活，而且可以繁殖后代，所以无眼果蝇的基因型可能为ee或e．进一步对其进行镜检，发现该无眼果蝇为IV-单体，缺少了一条IV号染色体，所以该变异属于染色体数目变异．（3）果蝇的红眼（B）和白眼（b）是由位于X染色体上的一对等位基因控制，将基因型为eXBXb和EeXBY的果蝇杂交，后代中有眼白眼个体的基因型可能为EeXbY或EXbY．（4）图2是果蝇红眼基因一条链的部分碱基序列及该基因编码的部分氨基酸序列，若由于基因一个碱基对改变，使赖氨酸变成了谷氨酸，则可推知图中红眼基因中碱基对发生的变化是T-A被C-G替换，该变异类型为基因突变．故答案为：（1）2（2）ee或e      染色体数目变异（3）EeXbY或EXbY（4）T-A被C-G替换    基因突变

点评 本题考查染色体数目变异和伴性遗传的相关知识，意在考查学生的识图能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．