R语言学习笔记

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2024-07-16 16:03:58| 来源: 网络整理| 查看: 265

采用ggplot2绘制误差线需要对数据转换求得mean和sd(或se等),可以通过Rmisc包summarySE函数、dplyr包group_by与summarise两个函数等实现,添加p-value(或显著性标记)可采用ggpubr包,然而添加p-value无需数据转换。这样,ggplot2同时绘制误差线与p-value则需要采用多数据框,太过复杂。下面提供一个简单的一步到位法。 #先加载包 library(ggplot2); library(ggpubr) #加载数据集ToothGrowth data("ToothGrowth") tg % map(~leveneTest(len ~ supp, data = .x, center = mean)) #不同dose下,Levene检验p值分别为0.052、0.149、0.129,表明各组总体方差相同(var.equal = TRUE)。 p + stat_compare_means(method = "t.test", method.args = list(var.equal = TRUE))

添加显著性标记

p + stat_compare_means(aes(label =..p.signif..), method = "t.test", method.args = list(var.equal = TRUE)) 如果是盒形图或折线图等或其他比较方法,代码可相应修改,可参考ggplot2绘制带有标准差图 、 R语言可视化学习笔记之添加p-value和显著性标记。


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