军队、自卫队与海上保安厅

1889年至1945年，1954年至今 大日本帝国海军军舰旗与自卫舰旗（日本海上自卫队使用）

1889年至1945年 大日本帝国陆军军旗

1972年至今 自卫队旗（日本陆上自卫队使用）

1972年至今 日本航空自卫队队旗

1951年至今 日本海上保安厅旗帜

1956年至今 日本海上自卫队的桅顶三角旗（Masthead Pennant，或称长旒旗）

日本自卫队的海上幕僚长旗

1965年至今 日本海上自卫队的海将（中将）旗

1965年至今 日本海上自卫队的海将补（少将）旗

1965年至今 日本海上自卫队的代将旗

1965年至今 日本海上自卫队的队司令旗 上为甲旗，下为乙旗

1965年至今 日本海上自卫队的先锋旗

1905年至1945年，2011年至今 大日本帝国海军与日本海上自卫队非正式用旗，“Z”旗

日本自卫队的统合幕僚长旗

日本自卫队的陆上幕僚长旗

日本陆上自卫队的方面总监旗

日本陆上自卫队师团长旗

日本陆上自卫队旅团长旗

日本陆上自卫队的步兵营旗

日本陆上自卫队的步兵连旗

日本自卫队的航空幕僚长旗

日本航空自卫队的空将（中将）旗

日本航空自卫队的空将补（少将）旗

1889年至1945年 大日本帝国海军大将旗

1914年至1945年 大日本帝国海军中将旗

1914年至1945年 大日本帝国海军少将旗

1914年至1945年 大日本帝国海军代将旗

1914至1945年 大日本帝国海军司令旗

1914至1945年 大日本帝国海军先任旗

1914至1945年 大日本帝国海军当值旗