RNA的提取条件较DNA要求严格。RNA由于自身结构和RNA酶的存在，极易降解。RNA酶是导致RNA降解的主要物质，RNA酶广泛存在人的皮肤和环境中，此酶非常稳定，常规高温高压灭菌方法和蛋白抑制剂不能使所有的RNase完全失活。

经高压灭菌的一次性使用的塑料制品如试管和离心管等基本上无RNase，可以不经预处理直接用于制备和贮存RNA。实验室用的普通玻璃器皿经常有RNase污染，使用前必须于180℃干烤8h以上，或用0.1%焦炭酸二乙酯（DEPC）的水溶液浸泡用于制备RNA的烧杯、试管和其他用品。DEPC是RNase的强烈抑制剂。同时需要注意的是：DEPC具体致癌性，操作时必须小心。

常用的RNA提取方法，有TRIzol试剂，苯酚，异硫氰酸胍-酚法等：

TRIzol法是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂，在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性，氯仿离心，异丙醇沉淀RNA。

苯酚法，将细胞置于十二烷基磺酸钠（SDS）的缓冲液中，加等体积水饱和酚，剧烈震荡，离心形成上层水相和下层酚相，核酸溶于水相。

异硫氰酸胍-酚法：用过异硫氰酸胍与β-疏基乙醇共同作用抑制RNase的活性。异硫氰酸胍与十二烷基肌氨酸钠作用使蛋白变性，释放RNA，在酸性条件下，DNA同蛋白质一起离心下来，RNA溶在上清中，该方法提取RNA纯度高，完整性好，适合纯化mRNA，逆转录和文库构建。

还有一些试剂盒，如RNA plant plus植物总RNA提取试剂盒（TIANGEN），总RNA提取试剂盒（Qiagen），总RNA提取试剂盒（Promega），使用简单、快速、高效，均能获得满意结果。

RNA检测：用NanoDrop2000（或更新的产品）测定RNA溶液的OD值，并计算OD260/OD280、OD260/OD230的比值，确定其纯度及浓度：

OD260/OD280为1.8~2.2（一般在2.0左右），当 OD260/OD2802.2时，说明 RNA 已经水解成单核酸了；

OD260/OD230也可表明 RNA 的纯度，OD260/OD230应>2.0，OD260/OD230