上消化道内镜检查对评估胃食管反流病的严重程度及排除由于其他原因导致反流的疾病具有重要价值。医生会对初诊的患者先行内镜检查，以了解是否有食管炎及其严重程度，同时结合病理活检结果排除肿瘤等疾病，对确诊的胃食管反流病患者，如出现报警征象，也应及时复查内镜。

是诊断及评估胃食管反流病最简单有效的工具。问卷设计基于患者就诊前一周内的症状，诊断精确性高，且能评价胃食管反流病对患者生命质量的影响，评价患者的治疗效果。

对于合并典型反流症状拟诊胃食管反流病或疑有反流相关食管外症状的患者，尤其是上消化道内镜检查阴性时，可采用质子泵抑制剂诊断性治疗。对表现为食管症状的患者，服用标准剂量质子泵抑制剂，如奥美拉唑，治疗的最后一周如症状完全消失或仅有一次轻度的反流症状，则可进行诊断。对表现为食管外症状的患者，一般共识。抗反流药物可能对部分胃食管反流病无效，故质子泵抑制剂试验阴性并不能完全排除胃食管反流病。

食管反流监测是胃食管反流病的有效检查方法，包括食管pH监测、食管阻抗pH监测和无线胶囊监测，对未使用质子泵抑制剂的患者可选择该项检查以明确食管存在酸反流并指导治疗。难治性胃食管反流病患者可使用食管阻抗pH检测判断症状持续存在的原因。采用多电极监测食管pH，可全面了解患者食管内反流情况，包括酸性和(或)碱性物质反流，特别是对反流水平(即是否存在高位反流、咽喉反流)的评价有帮助，在分析和解读pH监测结果时，要注意反流事件和症状的关联。

可帮助了解食管体部的动力功能状态、下食管括约肌的压力、一过性下食管括约肌松弛的频率以及上食管括约肌的功能，也可观察到食管在吞咽时的推进性蠕动功能。高分辨食管测压有助于了解胃食管连接部的解剖生理功能，食管动力学检测结果有助于治疗方案的选择，也是评估胃食管反流病患者是否适合手术治疗及预测手术疗效和术后并发症的重要指标。但不能作为诊断胃食管反流病的直接证据，但可以对手术前治疗后的功能恢复的评价手段。

食管钡餐检查可显示有无食管病变及胃食管反流，对诊断有补充作用，有助于鉴别诊断，但敏感性较低，不推荐为胃食管反流病的诊断方法。