TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

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TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

2024-07-11 17:32:49| 来源: 网络整理| 查看: 265

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质。TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA;用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。

TRIzol试剂可用于小量样品(50~100mg组织、5×106细胞)也适用于大量样品(≥1g组织、>107细胞)。对人,动物,植物组织,细菌均适用,可同时处理大量不同样品,整个提取过程在一小时内即可完成。

分离的总RNA无蛋白质和DNA污染,可用于Northern Blot,dot blot,ployA筛选,体外翻译,RNase保护分析和分子克隆。在用于RT-PCR时如果两条引物存在于一个单一外显子内,建议用无RNase的DNaseⅠ处理RNA样品,避免出现假阳性。共纯化的DNA可用作标准,比较不同样品RNA的得率,也可用于PCR和酶切。蛋白质可用于Western Blotting。

规格:100ml 黄色透明液体

储存条件:2~8℃避光保存12个月

注意:请勿直接接触皮肤或吞咽,以免灼伤。如接触皮肤应立即用洗涤剂和大量水冲洗。忌用乙醇擦洗,乙醇会加重灼伤程度。

预防RNase污染注意事项:

1.经常更换新手套,皮肤上常带有的细菌,霉菌可能成为RNase的来源。2.使用灭过菌的RNA专用塑料制品避免交叉污染。

3.RNA在TRIzol试剂中时不会被RNase污染,但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料制品可在0.5MNaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,高压灭菌,即可去除RNase。

4.配制溶液应使用无RNase的水(将水加入处理过不含RNase的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.01℅v/v,放置过夜,高压灭菌。注:DEPC有致癌之嫌,需小心操作)。

RNA的提取

准备试剂:氯仿,异丙醇,75℅乙醇,无RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制)。

操作步骤:

1. 匀浆处理:

a.组织将组织在液氮中磨碎,每50~100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。

b.单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。

c.细胞悬液离心收集细胞,每5~10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1mlTRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。

2.将匀浆样品在室温(15~30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。

3.可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2~8℃10000×g离心10分钟,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。

4. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。

5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。

6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0.5ml异丙醇,室温放置10分钟。

7. 2~8℃10000×g离心10分钟,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。

8. 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2~8℃不超过7500×g离心5分钟,弃上清。

9.室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大约晾5~10分钟即可.不要真空离心干燥,过于干燥会导致RNA的溶解性大大降低。加入25~200μl无RNase的水或0.5℅SDS,用枪头吸打几次,55~60℃放置10分钟使RNA溶解。如RNA用于酶切反应,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅的去离子甲酰胺溶解,-70℃保存。

注意事项:

1.从少量样品(1~10mg组织或102~104细胞)中提取RNA时可加入少许糖原以促进RNA沉淀。例如加800mlTRIzol匀浆样品,沉淀RNA前加5~10μgRNase-free糖原。糖原会与RNA一同沉淀出来,糖原浓度不高于4mg/ml是不影响第一链的合成,也不影响PCR反应。

2.匀浆后加氯仿之前样品可以在-60至-70℃保存至少一个月。RNA沉淀可以保存于75% 酒精中2~8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。

3.分层和RNA沉淀时也可使用台式离心机,2600×g离心30~60分钟。

预期产量:1mg组织或1×106细胞提取RNA分别为:肝和脾6~10μg ,肾3~4μg ,骨骼肌和脑组织1~1.5μg ,胎盘1~4μg ,上皮细胞8~15μg ,成纤维细胞5~7μg 。

常见问题分析:

得率低:

A.样品裂解或匀浆处理不彻底。

B.RNA沉淀未完全溶解。

A260/A28012000×g离心10分钟除去。

DNA的定量:取一份溶于8mMNaOH的DNA加水测A260值。一单位A260值相当于50μg/ml双链DNA。根据DNA产量可估计细胞数,人、大鼠、小鼠1×106二倍体细胞含DNA的量分别为7.1μg,6.5μg,5.8μg。

预期产量:1mg组织或1×106细胞提取DNA分别为肝和肾3~4μg 骨骼肌,脑组织,胎盘2~3μg 人,大鼠,小鼠培养细胞(1×106)5~7μg 成纤维细胞5~7μg。

应用:

1.用于PCR溶于8mMNaOH的DNA用0.1M HEPES调pH至8.4,取0.1~1μgDNA用作模板。

2.酶切反应用HEPES或1mM EDTA调节pH至适当值。每μg DNA使用3~5单位的酶,80~90%的DNA是可消化的。

1ml 8mM NaOH溶解的DNA样品pH值调节

Final pH 0.1M HEPES(μl)Final pH 1M HEPES(μl)

8.4 86 7.2 23

8.2 93 7.0 32

8.0 101

7.8 117

7.5 159

注意事项:

1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。

2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。

3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。

常见问题分析:

得率低:

A.样品匀浆和裂解的不彻底。

B.最终得到的DNA沉淀没有完全溶解。

A260/A280



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