科目三手动挡考试的全过程如下：

1、上车准备：首先，考生需要绕车一圈观察周围环境是否适合起步，特别要注意前后方是否有障碍物，并检查汽车是否出现异常情况。确认无问题后，考生可以上车，调整座椅和后视镜角度，并系好安全带。

2、夜间灯光模拟：根据考试系统的语音提示进行灯光操作，模拟夜间行驶情况。

3、起步：考生需要将离合器踩到底，挂入一档，放下手刹，打开左转向灯，并按喇叭发出信号。在确认安全后，考生可以起步。

4、直线行驶：在车速达到10-20千米/小时时，换入二档；当车速达到20-30千米/小时时，换入三档；当车速达到30-40千米/小时时，换入四档。

5、变道：考生在变道前需要观察后视镜，确认后方没有来车，然后打开相应的转向灯，逐次变换车道。每次只能跨越一个车道。

6、通过路口：考生在通过路口时需要适当减速，确保安全通行。

7、会车：考生在与其他车辆会车时需要保持安全距离，遵守交通规则。

8、超车：在确认后方没有来车的情况下，考生可以观察后视镜，并打开相应的转向灯，然后进行超车操作。超车前需要确认安全。

9、掉头：当需要掉头时，考生要控制好车速，并适时减速降档进行掉头。

10、通过人行横道、学校、公交车站：通过人行横道时，必要时需要停车礼让行人；在学校和公交车站附近行驶时，车速不能超过30km/h。

11、靠边停车：在靠边停车时，考生需要提前减速，打开右转向灯，并将车辆停稳后拉起手刹。