转录是RNA聚合酶（RNA Polymerase; RNAP）将遗传信息从DNA转移到RNA的过程，是遗传中心法则的关键环节。转录调控是基因差异化表达的决定性因素，决定了单细胞生物到高等动植物的几乎所有细胞层面的生命活动。因此，解析 RNAP的三维结构、工作机制与调控方式一直以来都是生命科学的前沿领域。细菌基因组由1个RNAP执行转录，真核生物的细胞核由5个RNAP执行转录（Polymerase I, II, III, IV, V；其中Pol IV, V为植物特有），线粒体基因组由1个噬菌体来源的RNAP执行转录，叶绿体基因组由1个噬菌体来源的RNAP和1个细菌来源的RNAP同时执行转录。

本研究组以噬菌体、细菌、酵母和植物的细胞核与细胞器RNAP为研究对象，探索了转录在基因表达、DNA修复、DNA甲基化过程中的重要功能和工作机制。主要的研究方向包括但不限于：1. 细菌转录机制和调控机理2. 细菌转录与DNA修复关联的分子机制3. 噬菌体和细菌免疫4. 植物Pol IV和Pol V介导基因组甲基化的工作机制5. 植物叶绿体的基因转录和调控机制6. 细菌和植物代谢途径关键酶的结构和催化机制解析