《徐霞客游记》中记载了峰林、孤峰、石芽、溶洞、石笋、石柱、溶沟、漏斗、竖井、落水洞、天生桥、岩溶湖、岩溶泉、地下河、地下湖、岩溶盆地、岩溶洼地、岩溶天窗、洞穴瀑布等20多种岩溶地貌的特征，还把它们定名和分类。其中，据有关学者统计，《徐霞客游记》中记载的石灰岩溶洞有288个，他亲自入内考察的就有250个。他对洞的形状、大小、深浅和洞口朝向都有详略不同的记载。对于洞穴生物、洞穴水文状况、洞穴利用情况、洞穴堆积物的形态、成因分析等，徐霞客都作了认真的观察和客观的记录。 据《徐霞客游记》记载，对桂林七星岩这样巨大而复杂的洞穴体系，徐霞客曾反复几次入内观察。“……洞口为庐掩，黑暗，忽转而西北，豁然中开，上穹下平，中多列笋悬柱，爽朗通漏，此上洞也，是为七星岩。……从其右历级下，又入下洞，是为栖霞洞。……由台上行，入一门，直北至黑暗处，上穹无际，下既然如此成潭，项洞峭裂，忽变夷为险。时余先觅导者，燃松明于洞底以入洞，不由台上，故不及从。而不知其处之亦不可明也。……既入，则复穹然高远，其左有石栏横列，下陷深黑，杳不见底，是为獭子潭。导者言其渊深通海，未必然也。……”（摘自《徐霞客游记》1637年农历五月初二日的日记） 1953年中国科学院地理研究所的科学工作者对桂林的七星岩进行了实地勘测，他们发现徐霞客当年踏勘过的15个洞口，至今大部分还可以找到。他们利用现代测量设备测绘的七星岩平面图和素描图，竟与徐霞客凭目测步量的结果惊人地接近，人们感叹徐霞客当年观察与描述的准确程度。 阳朔龙洞（今碧莲洞）的洞穴结构十分复杂，自北口入洞，下行可通往底层溶洞，西部则主要有8个洞口，上下层叠。徐霞客和静闻两人把龙洞岩四面八方的洞口全部深入探索了一遍，查清了各个洞口的联系，他在《徐霞客游记》中对这个洞有十分细致的描写，兴致极高：“如连环贯通，络绎层分，宛转俱透，升陟于层楼复阁之间，浅深随意，叠层凭空，此真群玉山头蕊珠宫里也。”洞内常有只容一人通过的岩隙，或必须攀爬才能通过的岩墙，徐霞客对此兴致盎然：“余与静闻高憩悬龙右畔，飘然欲仙，嗒然丧我，此亦人世之极遇矣。”喀斯特科学上的贡献，丁文江、翁文灏、任美锷、陈述彭、侯仁之、朱德浩、曾昭璇等地学大家都有很高评价。称徐霞客是我国乃至全世界石山学和洞穴学科创建之父，是有充分依据的。