Cytoscape软件下载、安装、插件学习[基础教程] |
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写在前面
今天分享的内容是自己遇到问题后,咨询社群里面的同学,帮忙解决的总结。 关于Cytoscape,对于做组学或生物信息学的同学基本是陌生的,可能有的同学用这个软件作图是非常溜的,做出来的网络图也是十分的好看,“可玩性”很高,就像前面分享的aPEAR包一样aPEAR包绘制功能富集网络图。自己在前面写论文的时候也是一直在使用,以前使用的版本是3.3.0的版本。但是,时间一长,很多操作都忘记。今天,在自己的台式机上使用Cytoscape软件,想要安装插件,但是发现3.3.0这个版本安装不了。随后,在社群咨询,各位同学也给出目前各自正常使用的版本。我们也就此机会,记录一下,分享一下。 注意:考虑到Cytoscape安装包下载,需要开梯子,我们这里已经下载好了对应的包,大家可以回复关键词获得链接。 后台回复关键词:20231129或Cytoscape即可获得下载链接 一、Cytoscape下载网址https://cytoscape.org/ ![]() ![]() ![]() ![]() 注意:考虑到Cytoscape安装包下载,需要开梯子,我们这里已经下载好了对应的包,大家可以回复关键词获得链接。 ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() PS:若你开了梯子下载速度会更快些,不开也不影响,只是速度相对慢一点而已。 插件操作学习对于初学者,我们这里借用SCIPainter(基迪奥)中莫北老师的教程进行操作,对于初学者很是的友好.网络图分析工具Cytoscape快速上手 导入数据![]() ![]()
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