显微镜检查结果虽有一定帮助但不具有确定性。脓尿的定义是非离心尿液标本的白细胞≥8个/mcL，相对应于离心沉淀标本的2～5个白细胞/高倍视野。大部分真性感染患者的尿白细胞>10个/mcL。不伴脓尿时的菌尿，尤其发现多种不同菌株时，常因取样过程中污染所致。近50%的患者有显微镜下血尿，但肉眼血尿并不常见。需要应用特殊染色来分辨白细胞管型和肾小管管型，前者仅提示存在炎症反应，可出现于肾盂肾炎、肾小球肾炎和非感染性小管间质性肾炎。

脓尿在没有菌和泌尿道感染是可能的，例如，如果患者有 肾结石, 尿路上皮肿瘤, 阑尾炎, 或 炎性肠病 或者标本被阴道白细胞污染。女性有 排尿困难 而没有明显菌尿的脓尿可能有间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征。

试纸法也常用。新鲜尿标本亚硝酸盐试验阳性（若标本无法得以快速检测，容器中的细菌复制会削弱结果的可靠性）对UTI具有高度特异性，但此试验的敏感性不高。在尿白细胞 >10WBCs/mcL 条件下，白细胞酯酶试验的特异性较高，同时具有一定的敏感度。对有典型症状的非复杂性感染的成年女性而言，多数临床医师认为显微镜检查和试纸法检测呈阳性已足够；在该类患者中，若已知可能的病原，进行尿培养除了显著增加费用以外并不能对治疗有所改变。

培养 建议在患者的特征和症状提示复杂性UTI或细菌治疗的指征时推荐。常见病例包括以下：

怀孕期妇女

绝经后妇女

男性

青春期前的孩子

患者有泌尿系统异常或尿道近期进行过有创性操作

患者的免疫抑制或明显合并症

患者其症状提示肾盂肾炎或败血症

复发性尿路感染（≥3/岁）

包含大量上皮细胞样本被污染，不太可能有帮助。培养需要未受污染的标本。早晨标本培养最有可能发现尿路感染。 样品在室温下> 2小时因持续的细菌繁殖菌落计数会假性升高。培养阳性标准包括从清洁中段尿或导尿标本中获得单株细菌。

无症状性细菌尿的培养阳性标准依据根据美国感染性疾病协会指南（参阅美国传染病协会成人无症状性菌尿患者的诊断与治疗指南）

连续2次清洁尿液（男性仅一次）标本发现同样细菌菌落计数>105/mL

男性或女性患者，导尿管尿液标本，细菌菌落计数>102/mL

对于 有症状的患者, 培养标准是

女性单纯性膀胱炎：> 103/mL

单纯性膀胱炎的妇女：> 102/毫升（这种定量可以提高对大肠杆菌检测的敏感性）。

急性单纯性肾盂肾炎的妇女：> 104/mL

复杂性尿路感染的女性：> 105/mL;或男性或女性导尿标本> 104/mL

急性尿道综合征：> 102单个细菌株

经由耻骨上膀胱穿刺获得的标本，任何培养阳性结果，无论计数，应该被认为是真阳性。

在中段尿中，混合菌群中的大肠杆菌E. coli可能是真正的病原体(1)。

少数情况下菌落计数较低时也存在UTI，可能因之前曾用抗生素治疗、尿液过度稀释（比重