适合新手:Jalview 多序列比对显示序列标识(超详细)

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适合新手:Jalview 多序列比对显示序列标识(超详细)

2024-07-13 16:01:28| 来源: 网络整理| 查看: 265

1.文件下载

安装前请先下载安装Java,下载完成后全部默认安装即可。进入界面,按照自己的电脑选择,然后直接下载就可以了

Download - Jalviewicon-default.png?t=N7T8https://www.jalview.org/download/

2.fasta 文件打开及分析

Jalview 软件只能打开fasta 格式,所以,你的txt文件或fasw文件可以直接改成fasta格式,更开后不会影响你的文件阅读(即更改后,记事本依旧能正常打开)。我的序列是aligment处理后的(可以用maga aligment处理,或在线网址进行aligment处理),

2.1 一般图片上不会展示下方的柱形图,我们可以删除

 2.2有些部分不需要自己再去处理,我们可以不用管他 2.3 重点讲解color及format部分:clolor部分包含三个部分 2.3.1部分一:text color,采用默认的黑色,不需要改 2.3.2 部分2颜色

 2.3.3 部分3: 2.4 Formats是调节图片展示方式的包含分行显示,字体大小,字体类型

最后图片的导出,每行显示多少,通过调节展示框来调节



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