质子泵抑制剂 (PPI)，或有时使用组胺-2 受体阻滞剂

扩张狭窄部位

胃底折叠术

质子泵抑制剂（减少胃酸生成的最强效药物）通常是胃食管反流病及其所致食管炎和糜烂性食管炎的最有效疗法。愈合通常需要服药 4 至 12 周。这些药物可长期持续使用，但如有必要，医生尽量使用低剂量。

组胺-2 (H2) 受体阻滞剂是另一类降酸药，对有轻度 GERD 症状的患者有效。

钾离子竞争性酸阻滞剂是另一类可阻断酸分泌的药物。这类药物在某些国家有售，但尚未在美国获准上市。

刺激内容物通过食管、胃和肠道的药物（称为促动力药，例如甲氧氯普胺）不如质子泵抑制剂有效，但可将其添加至质子泵抑制剂治疗方案中。

使用球囊或导管反复扩张狭窄区域，可治疗食管狭窄。如扩张成功，狭窄不会严重影响患者进食。

手术是治疗胃食管反流的一种方法，适用于不能耐受药物、大量反流非酸性物质但会引起症状，或者出现溃疡、出血、大疝或重度食管炎的患者。此外，手术可能也适宜于不愿多年服药的患者。也可选择使用腹腔镜执行微创手术（称为胃底折叠术）。然而，有些接受该手术的患者会出现副作用，最常见的是吞咽困难和进食后感觉腹胀或腹部不适。

使用质子泵抑制剂后，巴雷特食管一般不会消失，通常会保持不变。如果异常细胞转变为癌前病变，那么可在内镜下进行的治疗包括使用无线电波（射频消融）、极低温（冷冻疗法）或激光束（激光消融）破坏异常组织。或者，也可手术切除异常组织。但是，即使治疗缓解症状后，异常组织可能仍然存在。所以，有巴雷特食管的患者需定期接受内镜检查，确保疾病未进展至癌症。