GraphPad Prism 行列分组 (Grouped)图形绘制 |
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交错和分隔柱状图常用于展示不同组别间多个变量的数值对比,只有一个分组变量,但结局变量可以有多个。交错柱状图和分割柱状图是统一数据的两种不同表现形式,二者在本质上是相同的。本文实例介绍在GraphPad Prism中绘制交错和分隔柱状图的步骤。 关键词: GraphPad Prism; 行列分组表; 交错柱状图; 分隔柱状图 一、案例介绍研究A、B、C3种镇痛药运用在癌症患者的镇痛效果,3种药物分别取3个剂量:1.0、2.5、5.0 mg,将45名研究对象随机分成9组,每组5名,记录每名对象的镇痛时间Time (min),部分数据见图1。本案例数据可从“附件下载”处下载。 ![]() 本案例的分析目的是描述A、B、C3种药物在不同剂量下的镇痛时间,由于药物种类这一分类变量中含有不同剂量之间的比较,因此可以尝试绘制交错和分隔柱状图。 三、软件操作及结果解读 (一) 数据读取 1. 直接录入打开GraphPad Prism,在弹出的欢迎界面中,选择左侧New table & graph (新建图表)中的Grouped (行列分组表),Data table (数据表)选择Enter or import data into a new table (在新的数据表中写入数据),在Options (选项)中,选择Enter 5 replicate values in side-by-side subcolumns (在并排的子列中输入5个复制值),单击create创建数据表(图2)。 ![]() 在每一列Group下的5个子列中分别输入3种药物的镇痛时间(图3)。 ![]() 用户也可以导入已有的数据,具体过程如下: (1) 点击上方工具栏file中的import选项 (图4) ![]() (2) 在弹出对话框的右下角先选择需要导入的数据存放格式,然后选择用户的目标文件,单击OK(图5) ![]() (3) 在随后弹出的对话框Import and Paste Special Choice (导入并粘贴特殊选项)的Linking and embedding (联系和嵌入)中选择Insert data only (仅插入数据) (图6) ![]() (3) 由于该数据首行为药物剂量分组,因此需要在同一对话框中,选择Filter选项卡,在Rows (行)中,将Start at Row (从第几行录入)设置为2 (图7),点击Import (导入)即可 ![]() 将数据表重命名为“交错和分隔柱状图” (图8),对数据命名有助于日后的文件管理。如有需要,用户可以在Info部分对实验时间、实验编号和项目名称等进行简单描述,或者单击工具栏Sheet选项中的 ![]() 点击左侧导航栏中的Graphs(图表)部分下属图片文件,弹出Change Graph Type(更改图表类型)界面,选择Summary data (数据摘要)下的Interleaved bars (交错柱状图),单击OK (图9),结果见图10。 ![]() ![]() 单击选中图形中的标题、图例等,利用上方的Text工具栏可以对其字体、字号等进行修改 (图11),并可自由增加或删减图形中的元素。 ![]() (1) 在工具栏Change(更改)栏中,单击 (2) 在Data set(数据设置)下拉列表中可以选择单个数据集,也可以选择Change all data sets (选择所有数据集)对数据进行批量操作 (3) 在Border (边框)选项框选择合适的粗细,本例选择1pt (4) 在Dir. (方向)选项框选择Above (向上)使误差线保留上半部分,同时将Thickness (粗细)设置为1pt (图12) ![]() (5) 单击Fill (填充)选项框的下拉按钮,进入取色面板,选择条柱填充颜色 (6) 单击取色面板底部的More color& transparency (更多颜色&透明度),可以选择更多颜色和调整图标透明度 (图13) (7) 单击Add to Custom Colors (添加到自定义颜色)按钮,可以将定义好的颜色添加到左下角的Custom (自定义)中 (8) 选中该自定义颜色,单击OK即可设定颜色(图14) 其余数据集颜色设置同上。 ![]() ![]() 另一个便捷设置条状图颜色的方法便是单击上方Change(更改)栏中的Change colors (更改颜色)选项 ![]() ① 单击工具栏Change(更改)栏中的 ② 在Frame and Origin (框架与起始)选项卡下,Shape,Size and Position (形状、尺寸和位置)中可以对图标的X轴和Y轴的长短进行定义,还可以调整X轴和Y轴与边缘的距离,本例将X轴长度设置为12cm,Y轴高度为9cm ③ 在Axes and Colors (轴线与颜色)下可以对X轴和Y轴的粗细、颜色进行调整,本例中轴线粗细设置为1pt,颜色为白色 (图16) ![]() Y轴设置: ① 单击Format Axes (坐标轴格式)中的Left Y axis (左侧Y轴)选项卡,进入Y坐标轴的设置 ② 在All ticks (所有刻度线)中,通过Tick direction (刻度线方向)下拉选项,选择刻度朝向,本例中刻度朝向选择none (无刻度);通过Tick length (刻度线长度)选择刻度线长度,本例选择normal (默认) ③ 在Regularly spaced ticks (规则间隔刻度)中,通过Minor ticks (最小刻度)设置刻度间隔 (图17) 完成对Y轴的设置后,可同样的方法设置X轴。 ![]() 若需要添加横向网格线和整体框架,可以在Frame and Origin (框架与起始)选项卡中的Frame and Grid Line (框架和网格线)中进行设置。Major grid为主要网格,Minor Grid为次要网格,本例将Major grid设置为X and Y axis (X和Y轴),Minor Grid设置为Y axis (Y轴)。color (颜色)、Thickness (线条粗细)和Style (线条类型)可以设置网格线的颜色、粗细以及样式,具体设置见图18,结果见图19。 ![]() ![]() 以上绘制的图形为同一药物3种剂量下镇痛时间的分布情况,而GraphPad中还提供了多种不同的图形绘制方式用于展示同一数据,并可以互相转换,具体操作步骤如下: (1) 在工具栏Change(更改)栏中,单击 (2) 鼠标选中除第一个数据集以外的所有数据集,单击Relation of selected data set with the previous one (所选数据集与前一个数据集的关系)中的Separated (Grouped) (分隔组别),单击OK (图20) (3) 将图例移动至合适位置,结果见图21 ![]() ![]() 其他更多设置,可以根据需要在相应部分进行操作。 我要纠错 End |
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