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2024-07-16 08:30:18| 来源: 网络整理| 查看: 265

超分辨显微成像技术

已有 12282 次阅读 2019-4-2 10:40 |系统分类:科研笔记

专家解读丨庄小威组在Science总结超分辨显微成像技术[color=rgba(0, 0, 0, 0.298)]原创: [color=rgba(0, 0, 0, 0.298)]苏乾 孙育杰[url=]BioArt[/url] [color=rgba(0, 0, 0, 0.298)]今天

解读丨苏乾、孙育杰(北京大学生命科学学院)

责编丨迦溆

早在1835年,英国科学家乔治・B・爱里(George B. Airy)就提出了“爱里斑”理论:基于光的衍射特性,即使一个无限小的发光点在通过透镜成像系统后,也会形成一个弥散的图案,称为“爱里斑”。爱里光斑在成像平面附近的三维的光强分布被称为光学系统的“点扩散函数”(point spread function,PSF)。随后在1873年,著名的德国科学家恩斯特・阿贝(Ernst Abbe)基于此原理提出了“阿贝光学衍射极限理论”(diffraction limitation),经典的公式也作为其重要成就刻于其墓碑上:

Ernst Abbe的墓碑。图片引自:https://en.wikipedia.org/wiki/Diffraction-limited_system

其中,为光学系统的分辨率(即能分辨的两点之间距离),是探测的发出的光的波长,是成像系统中介质的折射率,是物镜聚焦光锥(light cone)的半角,而又称为一个光学物镜的“数值孔径”(numerical aperture, NA)。根据这一公式,光学显微系统的分辨率极限被限制在约检测光波长的一半,200~300纳米左右(可见光波长范围400-700纳米)――即当两个无限小的点光源相距200纳米以内时,它们的点扩散函数(或是它们的爱里斑)会有很大的重叠造成无法区分的现象,即达到了光学衍射极限。

然而,曾经被认为是不可逾越的理论物理极限,在一个多世纪后的2000~2006年,被相继出现的一系列超高分辨率显微技术“打破”了。诸如“4Pi显微技术”、“基态损耗显微技术”(Ground State Depletion microscopy,GSD)、“受激辐射损耗显微成像技术”(STimulated Emission Depletion, STED)及其衍生“可逆饱和光学荧光转化显微技术”(Reversible Saturable Optical Fluorescence Transitions)、“(饱和)结构光照明显微技术”((saturated) Structured Illumination Microscopy, (s)SIM/NL-SIM))及其衍生“非线性SIM”(NL-SIM)、“随机光学重构显微技术”(STochastic Optical Reconstruction Microscopy, STORM)、“(荧光)光敏定位显微技术”((fluorescent) Photo-Activated Localization Microscopy, (f)PALM)、“点积累在纳米尺度的地形成像技术”(DNA - Point Accumulation for Imaging in Nanoscale Topography,(DNA)PAINT)、“超高分辨光学涨落成像技术”(Super-resolution Optical Fluctuation Imaging,SOFI)以及“光漂白和光闪烁的贝叶斯分析技术”(Bayesian analysis of Bleaching and Blinking,3B)等,加之近些年新出现的“最小光子流量成像技术”(nanoscopy with minimal photon fluxes,MINFLUX)、“离散分子成像技术”(Discrete Molecular Imaging,DMI)和“膨胀显微技术”(expansion microscopy, ExM)等,它们通过对标记分子物理原理,化学机制亦或是样品尺寸的研究和改造,成功地“越过”了这一衍射极限。科学家们得以用前所未有的视角观察奇妙的生物微观世界,并带来了瞩目的生物学研究成果。

2018年8月31日,作为STORM超分辨显微技术的发明创始人,哈佛大学庄小威(Xiaowei ZHUANG)教授在Science杂志的特刊Science Special Section“技术改变生物”(图1左)上以通讯作者身份发表了题为Visualizing and discovering cellular structures with super-resolution microscopy的综述文章【1】(图1右),总结了以上提到的超分辨显微成像技术,并详尽地梳理了自问世以来,超分辨显微技术在观察和发现新的细胞结构、功能方面的卓越贡献。

图1 《科学》杂志特刊及庄小威教授发表的综述文章【1】

01

超高分辨显微成像技术有哪些?

通常来说,现有的超高分辨显微技术被分为两大类,以STED和SIM为代表的“基于点扩散函数修饰”和“结构光照明”,还有以STORM/PALM为代表的“基于单分子荧光定位”的超分辨技术(图2)。

第一大类中,STED及其衍生RESOLFT都是利用“甜甜圈”状的空心光束来修饰位于中间激发光的PSF,从而达到直接超分辨成像的目的。不同的是STED利用了荧光染料分子的“受激辐射损耗”性质,RESOLFT利用了荧光蛋白的“光控可逆转化”(photo-reversible)性质。而(s)SIM则是利用了包含样本的结构信息的干涉图案“摩尔条纹”照明方式,加上后期的图像重构,达到超分辨成像的目的,此外,通过引入非线性光学,NL-SIM可以达到更高的分辨率。

第二大类中,STORM和PALM都是利用了荧光染料分子“光控开关”(photo-switchable)或者荧光蛋白的“光控转化”(photo-convertible)性质,达到在一个衍射极限空间内(200~300 nm)随机“点亮”单个荧光分子并进行高精度定位的目的。类似地,PAINT技术利用了对化学反应常数的精确调控,从而达到类似的“点亮”效果(带有荧光标记的分子和靶向分子之间的短暂结合)。

除上述两大类之外,新兴的MINFLUX技术【2】综合了两类成像技术的优点,将定位精度提高到了前所未有的1纳米;膨胀显微技术ExM【3】通过直接将被成像样品进行物理膨胀的手段,间接达到超分辨成像的目的。此外,还有基于荧光信号的涨落,如闪烁(blinking)和漂白(bleaching)的SOFI和3B技术,他们的出现进一步丰富了超高分辨率显微技术的选择和应用。感兴趣的读者可以从下面三篇综述文章中获取更多信息【4-6】。

 

图2 两大类超高分辨显微技术,基于单分子定位的STORM/PALM,基于点扩散函数修饰的STED/RESOLFT【7】

02超高分辨显微技术有多厉害?

技能一:三维解析能力

2.1

三维解析能力对于超分辨成像技术在生物样品中的应用甚是重要。值得一提的是,“基于单分子定位”的超分辨成像技术借鉴了很多天文学研究的算法,Z轴分辨就是其中一个:通过在成像光路中引入一个柱面透镜达到对点扩散函数的修饰,从而实现三维成像,但Z轴较XY平面分辨率稍差。此外,还有双焦面成像,PSF工程改造和干涉等方法来实现超分辨显微技术的三维解析能力。在STED和RESOLFT中,通过双物镜产生相互抵消的“甜甜圈”照明实现了各向同性的三维超分辨解析能力。

技能二:空间分辨率能力

2.2

超分辨成像技术的重中之重,当然是分辨率的提升。理论上,不论是基于结构光照明的STED,RESOLFT和NL-SIM,还是基于单分子定位的STORM和PALM,都是不受衍射极限约束的,所以他们的理论分辨率是无穷小【1】。但是,在实际的生物样品拍摄中,分辨率受到很多因素的影响,例如激发光的效率,探测器的灵敏度,标记物的光物理性质及其物理大小,标记效率和密度等因素,当然还有生物样品本身的散射和吸收问题。在实际的生物样品拍摄中,这些技术通常能达到10-70纳米的分辨率,少数情况下可以达到小于10纳米的分辨率(比如双物镜STORM,基于DNA-PAINT的DMI和MINFLUX技术等)。

下表简单总结了几种主流超分辨技术的原理、三维成像能力、分辨率和荧光基团要求(总结并不完全,欢迎指正、补充)。

表1 主流超分辨显微成像技术参数总结【1, 4, 6】

对于较厚的生物样品,为了解决散射的问题,近些年发展的适应光学系统(Adaptive Optics, AO),光片照明技术(Light-Sheet Illumination),组织透明化处理(Tissue Clearing)和物理切片等技术方法也取得了可喜的成果。

 

技能三:活细胞成像,时间分辨率和光毒性

2.3

对于STED,RESOLFT和SIM来说,活细胞成像、时间分辨率都是其技术优势,STED和RESOLFT在较小的视场下可以达到很高的时间分辨率( 收藏 IP: 202.100.211.*| 热度|



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