肚脐眼正上方3-5厘米疼痛，使劲按压之后疼痛可能是由胃溃疡、肠结核、胆囊炎等原因引起的。具体如下：

1、胃溃疡。肚脐眼正上方3-5厘米疼痛，使劲按压之后疼痛可能是由胃溃疡所致。由于患者出现胃溃疡之后，会导致患者胃黏膜损坏，所以会出现局部疼痛等不良症状。患者用手按压局部时，会导致疼痛加重。患者可使用克拉霉素、阿莫西林等药物进行治疗。

2、肠结核。肠结核是结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染。患者主要表现为腹痛、大便习惯改变、腹部肿块等。严重肿块会扩散到肚脐眼正上方3-5厘米处，出现按压疼痛、局部胀热等不良表现。可以及时用吡嗪酰胺、乙胺丁醇等药物进行治疗。

3、胆结石。如果患者患有胆结石，当结石掉落时，胆囊管内会出现发热、肿胀等不良现象，部分患者还会发生在肚脐上方出现疼痛感，按压时疼痛会加重。对于该情况，患者需及时去医院就诊，及时进行治疗。