ENCODE还开辟了一种数据挖掘的新程序，称为“主题线程”（ThemedTherads）。它将ENCODE的所有数据和Nature等杂志发表的几十篇论文，汇总在一起，可以依据主题，通过虚拟计算机进行数据的调阅、拼接、分析、整合和预测。这也为今后生命科学和复杂疾病的研究增添了一个新的、有力的工具。

ENCODE的公开发表，使“人类基因组不再是一个空壳了”。它是人类生命科学研究又一个新的里程碑！它为人类遗传发育、生理功能、发病机制的研究和药物开发奠定了牢固的科学基础。具有十分重要的理论意义和实际应用价值，关系到我们人体每一种结构，每一种功能，每一种疾病，每一种药物的研究、开发和应用。为我们提供了一个精确的基因结构、功能图谱和调节控制的面板，可在系统和整合的水平上，预测分析与疾病相关基因的结构、变异、功能和调节的改变，为医学生物的研究开辟了一条崭新道路。

ENCODE项目具体在以下方面取得重要进展：

1. 转录因子的足迹分析

2. 人基因组DNA元件集成百科全书

3. 人细胞转录全景图

4. 人基因组中可访问的染色质全景图

5. 基因的三维立体结构图谱

6. 人基因组调控网络结构

7. 基因启动子的远距离相互作用全景图

8. 果蝇和人的转录因子结合位点变异分析

9. 重新界定了“基因”的含义，明确了功能基因的定位、变异和调节

10. 转录因子TCF7L2通过GATA3结合到基因组上

11. 构建定量模型研究染色质特征和基因表达水平之间关系

12. GENCODE假基因资源

13. 对人启动子的转录因子结合位点进行功能性分析

14. 基于转录相关因子的结合位点对人基因组区域进行分类

15. 利用RegulomeDB标注个人基因组中的功能性变异

16. 制定ChIP-seq工作标准和指导准则

17. 利用RT-PCR-seq和RNA-seq统计所有人基因组编码的基因元件

18. 初步分析了基因变异与疾病的相互关系

ENCODE是医学生物学的GPS，将指导我们进行生物医学的研究和实践！我们需要认真学习，深入研究，加速转化。不断补充和丰富ENCODE，书写生物医学与功能和疾病防治相关的新一版的ENCODE。

来源：浙江省生物信息学学会

医学科研干货免费下载，请关注“肽度时界”公众号，关注后回复“指定数字”获取：

1.医学科研实验常用protocol--回复“001”领取

2.质粒图谱大全--回复“002”领取

3. 医生晋升方法/执业医生题库/晋升程序与制度/考试口诀等--回复“003”领取

4.中国互联网预约挂号服务市场专题研究报告2016--回复“004”领取

5. 科研必备软件（12大分类50款）免费下载 --回复“005”领取

6. 2016年全球二代基因测序行业投研报告 --回复“006”领取

7. lncRNA超级干货（68篇文献免费阅读） --回复“007“领取

8. SCI论文超级干货合集（SCI论文写作技巧+配图软件+施一公大咖经验+文献检索+SCI经验书籍） --回复“008” 领取

9. 中国移动医疗市场年度研究报告2016 --回复“009”领取

10.信号通路与信号转导系列文件+Cell网站细胞信号通路图（超多干货）--回复“010”领取返回搜狐，查看更多