中国（广东）自由贸易试验区广州南沙新区片区总面积60平方公里（含广州南沙保税港区7.06平方公里），共7个区块，分为中心板块、海港板块、庆盛板块。   

　　1.海港区块15平方公里。海港区块一，龙穴岛作业区13平方公里(其中南沙保税港区港口区和物流区面积5.7平方公里)。海港区块二，沙仔岛作业区2平方公里。   

　　2.明珠湾起步区区块9平方公里，不包括蕉门河水道和上横沥水道水域。   

　　3.南沙枢纽区块10平方公里。   

　　4.庆盛枢纽区块8平方公里。   

　　5.南沙湾区块5平方公里，不包括大角山山体。   

　　6.蕉门河中心区区块3平方公里。   

　　7.万顷沙保税港加工制造业区块10平方公里 (其中南沙保税港区加工区面积1.36平方公里)。 　  

　　【地形地貌】 

　　南沙新区地貌表现为明显的河口冲积形态，区内水网密布，地势平坦。陆地的绝大部分为平原田地，由河道沉积和人工围垦共同作用形成，其中下横沥水道以南的万顷沙是1960 年代以后人工围垦的新增陆域地区，龙穴岛则是1990 年代以后随产业开发进行的填海开发地区。由于其沉积平原的形成机制，新区陆域海拔较低，平均高程在2米以下，且大多为淤泥、软土，部分地区软土层厚度可达40 米，地下水位较浅。全区零星分布若干山体，主要包括大山乸、庐前山、乌洲山、骝岗山、大虎山、小虎山、黄山鲁、十八罗汉山，全区制高点位于黄山鲁，最高点海拔294.17 米。 

　　【自然气候】 

　　南沙新区属低纬地区，位于北回归线以南，为亚热带季风气候。常年气候和，雨量充沛，日照丰富，年平均气温21.9 摄氏度，平均年降雨量1600~2000毫米，降雨主要集中在4~9 月。常年盛行两个主要风向，冬季盛行偏北风，夏季盛行偏南风；偏北风的频率较偏南风的频率大，风速相近。  

　　【生态特征】  

　　河口沉积平原的属性造就了南沙新区大规模的自然生态湿地，南沙有全国首个湿地森林公园，3000 多亩湿地、400 多亩红树林、2 万多只秋冬季节的候鸟，自然湿地对河口水生态系统的运行起到至关重要的作用，南沙的生态湿地也被称为“广州之肾”。