清华大学档案馆成立于1991年10月，馆内设文书档案部、科技和人物档案部、人事档案部和综合事务部。档案馆与财务处、实验室管理处、信息化技术中心、党委宣传部（新闻中心）、出版社、美术学院、深圳国际研究生院、附属中学、附属小学、第一附属医院、第二附属医院、北京清华长庚医院等单位合作设立档案馆分室。

新中国成立前，学校因几经辗转，仅剩200余箱未经整理的文书材料。1964年成立附设于校长办公室的档案室，1979年11月建立由校党委直接领导的清华大学档案室，1991年10月成立档案馆，1992年3月新馆落成后，实现了全校档案的集中管理。

档案馆馆藏档案包括清华学堂、清华学校、国立清华大学、长沙临时大学、西南联合大学和清华大学等各主要历史时期的文书档案；清华建校以来的学生学籍注册卡、成绩单；科研、工程项目档案；历年获奖教材；学校各建筑物基建档案、图纸；纸质、电子版研究生论文档案；在校教职员工和学生的个人档案，以及著名校友实物档案，大...