WB条带大小与预期不符或多条带?完整版原因分析+解决方案来啦 |
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我们上一期讲解了WB条带无信号或信号弱的问题及解决方案,在做WB实验时,你是否经常还会遇到检测条带大小与预期不符或多条带等问题?
预期实验结果图 图1 比靶标蛋白分子量小的位置出现多条条带 图2 比靶标蛋白分子量大的位置出现多条条带 图3 不同分子量大小的位置出现多条条带 图4 检测条带小于预期分子量大小 图5 检测条带大于预期分子量大小 当WB实验出现检测条带与预期不符或者多条带等现象时,我们归纳整理发现,主要是由于样本和靶标自身特性以及WB实验流程中的样本制备、抗体孵育和封闭等具体实验细节问题所引起的,接下来将详细介绍一下出现检测条带与预期不符及多条带等现象的原因及具体解决方案,一起来看看吧! 样本和靶点特性1. 细胞传代次数过多,使其蛋白表达不同,导致检测条带大小与预期不符或多带现象。 可通过如下建议解决: 使用原始未传代的细胞株,和现在的细胞株一起做平行对照实验。2. 蛋白样本降解,导致检测蛋白质分子量降低或多带现象。 可通过如下建议解决: 在样品缓冲液中加入足量的蛋白酶抑制剂。3. 体内表达的蛋白样本具有多种修饰形式如乙酰化、甲基化、烷基化、磷酸化和糖基化等,导致检测条带大小与预期不符或多带现象。 可通过如下建议解决: 查阅文献,检查是否有多带报道;我们总结了WB检测易出现多带现象的热门靶标实验结果及原因解释,供大家参考(附录5:热门靶标蛋白多带现象及原因解释)。以部分热门靶标为例,欢迎点击上方“附录5”链接查看全部靶标信息 由于翻译后修饰(PTMs),如磷酸化和糖基化或选择性剪切变异体,许多蛋白实际检测的条带分子量略高于预期或出现弥散条带;我们总结了实际检测条带大小与预期不符的热门靶标WB检测结果示例,及原因解释,供大家参考(附录6:热门靶标蛋白检测条带大小与预期不符及原因解释)。为了确认额外的条带是由翻译后修饰引起的,可以用合适的试剂处理样品来处理修饰过的蛋白质。例如,PNGase F可以去除糖基化,当处理后再进行WB实验时,额外的糖基化条带应该会消失;我们总结了实际检测条带大小与预期不符的热门靶标WB检测结果示例,及原因解释,供大家参考(附录6:热门靶标蛋白检测条带大小与预期不符及原因解释)。以部分热门靶标为例,欢迎点击上方“附录6”链接查看全部靶标信息 4. 靶标蛋白含有多个异构体或剪切体,导致检测条带大小与预期不符或多带现象。 可通过如下建议解决: 查阅文献,检查是否有异构体;我们总结了多个热门靶标预测分子量大小及异构体信息,供大家参考(附录4:热门靶标蛋白分子量)。以部分热门靶标为例,欢迎点击上方“附录4”链接查看全部靶标信息 注: (1)有些特殊蛋白,由于翻译后修饰、剪切或降解等因素影响,WB实际检测分子量大小可能与预测不符,或有弥散现象。 (2)有些蛋白可能有多个异构体,因此WB检测时可能会有多带现象。 (3)同一蛋白的多个异构体表达模式可能不同,即不同样本中,未必都能检测到同一蛋白所有的异构体。 查看免疫原序列,判断抗体是否识别异构体或剪切体。5. 检测到未经报道过的新蛋白或同一蛋白家族中具有相似表位而结构不同的蛋白。 可通过如下建议解决: 查阅文献,或BLAST搜寻,使用说明书推荐的细胞株或组织。 实验流程样本制备 靶蛋白形成多聚体 可通过如下建议解决: 这可能出现高分子量的额外条带,它们的分子量可能是预期条带的2倍或3倍;我们总结了实际检测条带大小与预期不符的热门靶标WB检测结果示例,及原因解释,供大家参考(附录6:热门靶标蛋白检测条带大小与预期不符及原因解释)。SDS-PAGE电泳上样前,煮沸10分钟而不是5分钟,使蛋白质解聚。对于多次跨膜蛋白,可尝试不煮样或使用较温和的煮样方式。封闭 条带为非特异性条带 可通过如下建议解决: 应用封闭多肽来区分特异性和非特异性条带,只有特异性条带能被封闭从而消失。一抗孵育 一抗浓度过高,高浓度时常出现多条蛋白带 可通过如下建议解决: 降低抗体浓度和/或孵育时间。抗体未经纯化 可通过如下建议解决: 使用亲和纯化的抗体,减少非特异条带。二抗孵育 二抗浓度过高,高浓度产生非特异性结合 可通过如下建议解决: 降低抗体浓度,增加二抗对照(只加二抗不加一抗的对照)。下一期,我们将把目光集中到WB出现高背景和其他问题(除无信号、条带问题外),并给大家提供原因分析和优化方案,记得来围观哦。 |
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