Triangle(三角图) |
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——Triangle代码 三角坐标统计图是采用数字坐标形式来表现三项要素的数字信息图像。三角形坐标图常用百分数(%)来表示某项要素与整体的结构比例。三条边分别表示三个不同分量,三个顶点可以看作是三个原点。三角图可以展示某特定值在一个整体中不同类型的分布。在生物信息中三角图可以方便地展示3种不同疾病或者3个不同分组之间某个指标的相关性。 数据要求 多个样本的三个变量值,或者多个基因在三个不同分组中的数据值,可以是突变频率数据、基因表达数据、甲基化数据等。 图形示例: 图注: 三个角为三个不同分量的原点,箭头代表三个坐标轴延伸方向,每个点的坐标沿平行灰色的方向进行读值。该图为基因突变频率数据,越靠近三角形的一个角,代表在这个类型突变越多。点的大小代表基因在整个样本群中总共的突变频率,点的颜色代表各个类型相对突变频率。
应用示例: 文献1:MutationalLandscape of Secondary Glioblastoma Guides MET-Targeted Trial in Brain Tumor.(于2018年11月发表在cell,影响因子36.216) 脑肿瘤中的继发性胶质母细胞瘤导向MET靶向试验中的突变研究 本文研究了继发性胶质母细胞瘤中的基因突变模式,并研究了MET靶向融合与关键突变的相关性。文中绘制三角图展示了不同基因在不同癌症类型中的突变频率分布。
文献2:Comparativemet agenomics of hydrocarbon and methane seeps of the Gulf of Mexico(于2017年12月发表于Sci Rep.,影响因子4.011) 墨西哥湾烃和甲烷渗透下的比较基因组分析 文章研究了墨西哥湾不同有机物渗透环境下的微生物基因表达情况,文中绘制三角图展示了不同渗透区域微生物不同通路基因表达的差异。 |
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