R语言复现一篇6分的孟德尔随机化文章 |
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上一期我们对孟德尔随机化做了一个简单的介绍,今天我们来复现一篇6分左右的使用了孟德尔随机化方法的文章,文章的题目是:Mendelian randomization analysis does not reveal a causal influence of mental diseases on osteoporosis(孟德尔随机分析没有揭示精神疾病对骨质疏松症的因果影响)
我们可以看到第一个精神分裂症(Schizophrenia)是来自GWAS的ieu-a-22,我们先查看一下对得上吗?ieu-a-22确实是精神病,样本量是82,315,和作者提供的对得上,我又拿它和作者提供的数据比对了一下,也是一样的。拿这个数据做暴露的数据应该是没问题。
先导入暴露变量数据(详细操作可以看上一章),作者在这里把暴露数据定义为aaa aaa |
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