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DimPlot函数参数解析

栅格化点图

放大 ggplot2 图例的点，修改图例的标题

FeaturePlot函数参数解析

调整FeaturePlot颜色

 分组绘制featureplot

随手笔记，持续更新中。。。

Reference

object: 一个Seurat对象，包含要进行可视化的数据集。

dims: 一个长度为2的数字向量，指定要绘制的维度，通常是c(1, 2)来表示降维结果的前两个维度。

cells: 一个可选的向量，指定要在图中显示的细胞。默认为所有细胞。

cols: 用于指定点的颜色的向量或预定义的颜色方案。默认情况下，使用ggplot2的颜色方案。

pt.size: 用于调整点的大小。

reduction: 指定要使用的降维方法，例如"umap"、"tsne"或"pca"。如果未指定，DimPlot会依次查找"umap"、"tsne"、"pca"中可用的结果。

group.by: 一个字符串，指定用于颜色编码的元数据变量，如细胞标识或任何其他分类变量。

split.by: 一个可选的字符串，指定一个元数据变量名，按此变量的值拆分数据并单独绘制每个组的图。

shape.by: 一个字符串，允许根据指定的元数据变量改变点的形状。默认情况下，所有点都绘制为圆形。

order: 一个向量，指定不同标识（如细胞类型）的绘制顺序。有助于在图中凸显某些细胞群。

shuffle: 一个逻辑值，指定是否在绘制前随机打乱点的顺序。有助于避免绘图中的遮挡问题。

seed: 当shuffle = TRUE时，用于随机数生成的种子，确保结果可复现。

label: 一个逻辑值，指定是否在图上标记每个群组（如细胞类型）。

label.size: 标签文字的大小。

label.color: 标签文字的颜色。

label.box: 一个逻辑值，指定是否在标签周围添加边框。

repel: 一个逻辑值，指定是否使用标签排斥机制，以避免标签相互遮盖。

cells.highlight: 指定要突出显示的细胞向量，这些细胞将以不同的颜色或大小突出显示。

cols.highlight: 用于突出显示的颜色向量。

sizes.highlight: 突出显示的细胞的大小向量。

na.value: 在使用自定义颜色比例时，为缺失数据（NA）点指定的颜色值。

ncol: 当绘图组合时，指定列的数量。

combine: 一个逻辑值，指定是否将多个图合并为一个图对象。如果为FALSE，则返回一个包含多个ggplot对象的列表。

raster:是否栅格化(图像中的点是拼合后的位图，不再是矢量图)。如果点超过10万个，自动栅格化。

raster.dpi:栅格化后的分辨率，传递给 geom_scattermore()，默认 c(512, 512)

...: 其他传递给DimPlot的额外参数，这些参数会进一步自定义绘图的外观和行为。

group.by 参数 tip：默认是 ident 分组，通过修改 Idents(rds)