如何查找基因序列

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如何查找基因序列

2024-07-15 08:15:04| 来源: 网络整理| 查看: 265

如何查找基因序列?

——在Genbank中寻找目的基因的实例

1. 根据文献

搞reasearch肯定要读文献的,如果你曾经在文献中看到过你感兴趣的基因,而且文中还提到了该基因在Genbank中的ID号,那就好办了,直接打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov ,在Search后的下拉框中选择Nucleotide,把Genbank ID号输入GO前面的文本框中,点“GO”,就可以找到他了。

举例说明,例如:在2003年JBC的文章(Conditional Knock-out of Integrin-linked Kinase Demonstrates an Essential Role in Protein Kinase B/Akt Activation)中出现了“calreticulin (GenBank accession number gi 16151096)”,那么把“16151096”输入GO 前面的文本框中,点“GO”,就可以找到该基因了(当然包括基因序列等相关信息)。

在出现了检索结果界面(下图)后,直接点击红箭头所指的AY047586就可以看到基因的相关信息了...(呵呵,是不是有点太......easy了)

这里需要指出一下,在显示基因的页面右侧有一个Link,点击后出现一个小菜单,里面是与该基因相关的链接,很有用的,值得一个一个地去看看,这里我就不多说了。

点击AY047586后出现的界面如下:

如果你只想获得序列(例如去设计PCR引物的时候),那就可以选择FASTA,这样就得到了FASTA格式的序列文件,没有其他数字和格式的干扰。

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