Java Web和小程序开发是两种不同的技术，主要的区别在于应用场景和技术实现方面。

Java Web开发主要是针对网页应用程序的开发，包括前端设计和后端开发。Java Web开发需要掌握Java语言，Web前端技术（如HTML、CSS、JavaScript等）以及Web后端技术（如Servlet、JSP、Spring等框架），还需要掌握数据库相关技术（如MySQL、Oracle等）。

小程序开发则是针对移动端应用程序开发，主要在微信平台上进行，需要掌握微信小程序开发文档和开发工具。小程序开发需要掌握前端技术（如HTML、CSS、JavaScript等），以及微信小程序框架（包括小程序组件、API、事件等）。

要更好的运用Java Web和小程序开发，可以根据不同的应用场景选择合适的技术。Java Web适用于开发网站、电商平台等需要大量数据处理的项目，而小程序适用于开发移动端应用，满足用户移动端场景下快速浏览、分享、购买等需求。同时，也可以考虑将两者结合使用，通过微信公众号、微信支付等技术打通线上线下，实现更好的用户体验和增强营销效果。