▲图2 STR基因分型结果

STR位点基因分型结果峰图

在报告中会给出受检细胞系的STR检测结果峰图（图3），该峰图是实际PCR扩增后检测到的片段长度和分型信息。位点信息与表1（图2）相同。

▲图3 STR基因分型结果峰图

*STR: 短串联重复序列（short tandem repeats，STR）也称微卫星DNA（microsatellite DNA）, 通常是基因组中由1~6个碱基单元组成的一段DNA重复序列，由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富，构成了STR基因座的遗传多态性。

▲图4 STR 短串联重复序列

* 纯合子：Homozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因相同。即显示单个峰。

* 杂合子：Heterozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因不相同。即显示2个峰。

▲图5 STR位点峰图

人源正常组织细胞其STR图谱，一个基因位点仅出现一个或2个峰（更多信息请查阅短串联重复序列 (STR, short tandem repeats) ）。 如发生细胞交叉污染现象，基因位点会出现多等位基因，即一个基因位点出现3或4个峰（图6）。当然，也不能排除可能为三倍体等多倍体突变现象。

▲图6 多等位基因峰图

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STR位点基因分型结果比对

根据鉴定得到的细胞STR位点信息在ATCC、DSMZ等数据库中进行比对， 进入ATCC STR数据库页面（https://www.atcc.org/en/STR_Database.aspx ）输入检测细胞的9个STR位点信息，与ATCC数据库进行对比。

▲图7 ATCC 数据库比对

输入信息后给出比对结果（图8）

▲图8 ATCC数据库比对结果

同样在DMSZ数据库进行数据比对，得到匹配结果。

▲图9 DSMZ数据库比对结果

比对结果中"%Match"（ATCC, 图8）及 "EV" （DSMZ, 图9）列是受检细胞的9个STR位点基因分型数据与数据库中细胞的匹配度。

人源细胞STR鉴定结果判定标准：

受检细胞STR位点的基因分型数据与其对应的标准细胞系（其原始组织或衍生细胞系）STR基因分型数据进行比对：

1）若两者的匹配度≥80%，则判定受检细胞系为标准细胞系或为标准细胞系的衍生细胞系。

2）若两者的匹配度在56%-80%之间，建议结合细胞系形态、细胞系特异性标记物等辅助分析进行综合判断。

3）若两者的匹配度≤56%，则判定受检细胞样本与其对应的标准细胞系不相关。

参考文献：

1. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup,A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end. Nat Rev Cancer, 2010. 10(6):p. 441-8.

2. Reid Y, Storts D, Riss T, Minor L. Authentication of Human Cell Lines by STR DNA Profiling Analysis. Assay Guidance Manual [Internet]. Bethesda (MD): Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences; 2004-.2013 May 1.

本文转自：逍鹏生物返回搜狐，查看更多