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水果的无籽特性，具有重要的经济价值，假使香蕉变成有籽，那么，果实的大部分将会充塞着不能食用的种子，谁都不会喜欢吃这样的香蕉。无籽果实虽然受到消费大众的青睐，但在进化上，代表了一种生物学悖论，一方面，它们不能产生后代，对物种的保存和延续没有直接贡献；另一方面，野生环境下，无核果实虽然不能产生后代，但是在授粉条件差的年份，无核果实为动物提供了食物，这样就不会因为授粉条件限制而影响动物传播种子的积极性，从而保障整个种群的后代传播能力。如下假想图所示：果树为动物提供果实，动物帮助传播种子，这是个美好的约定。当授粉条件恶劣时，以单性结实的方式仍然为小动物提供了无籽果实，看似对树木无益，但真实的履行了约定。

图1 果树与动物的“约定”

君迁子（Diospyros lotus L.）是一种柿属重要植物，在我国广泛分布并且有着悠久的栽培历史。君迁子耐寒、耐干旱、耐瘠薄，已成为柿属植物种质创新的重要资源。君迁子通常雌雄异株，其果实可供食用，含有丰富的维生素与矿物质营养，大多数君迁子（黑枣）果实是多籽的，食用价值不高，但也有些品种是无籽的，具有很好的商品价值，一些无核品种已成为重要的栽培品种。君迁子种质资源可以分为圆形有核果、圆形无核果、长圆有核果、长圆无核果、扁圆有核果，是研究果实无核现象形成机制及进化意义的理想材料。

图2 君迁子的不同种质资源2021年5月，Forestry Research在线发表了北京市农林科学院林业果树科学研究院、北京市落叶果树工程技术研究中心实验室题为Chromosome-level genomes of seeded and seedlessdate plum based on third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis的论文，介绍了有核君迁子与无核君迁子比较基因组研究本次研究通过PacBio三代测序和Hi-C染色质构像等技术，对采自北京市平谷区镇罗营镇桃园村的有核、无核君迁子测序，成功组装了两个染色体级别的高质量基因组。有核、无核君迁子基因组大小分别为647.31 Mb、617.66 Mb，ContigN50 为2.46 Mb和3.01 Mb，注释了22,844和20,689个基因。通过基因组共线性分析在两个基因组整体结构上存在较高的同源性，但8号染色体、11号染色体上发现倒位和易位。进化分析表明有核、无核君迁子在590万年前分化。无核君迁子基因组基因家族扩张和收缩主要在脂质和MAPK信号通路，这些通路与植物激素调控相关，目前有研究发现植物激素在果实无核中有着重要作用。

图3 有核、无核君迁子基因组分析

同时基于目前发表的柿属物种基因组数据，构建了首个柿属基因组数据库——DGD（http://www.persimmongenome.cn），提供了在线基因组可视化浏览、序列比对、引物设计、数据下载等服务。DGD将不断进行数据更新以促进君迁子及柿属物种的分子生物学、功能基因组学和遗传进化的研究。

图4 柿属基因组数据库DGD

硕士研究生毛威涛，湖北工程学院的姚国新教授为该论文的共同第一作者，北京市林业果树科学研究院董宁光副研究员和胡广隆助理研究员为该论文的通讯作者，北京市林业果树科学研究院王尚德副研究员、湖北农科院周雷研究员、北京鑫桃源商贸有限公司总经理陈国松等也参与了该项研究。本论文得到北京市林业果树科学研究院青年基金（LGY201901），北京市农林科学院创新能力建设专项（KJCX20210114）资助。

https://doi.org/10.48130/FR-2021-0009

关于Forestry Research

Forestry Research是一本专注于林学领域的期刊，一本全新的国际化的、开放获取的、具有严格的编辑筛选和评估流程的期刊。主要发表与森林科学和多个相关领域的研究论文、方法、综述和观点；涵盖范围从分子到种群，再到生态系统。期刊主编由美国密歇根理工大学林业资源与环境学院卫海荣教授担任。

期刊官网：

www.maxapress.com/forres

投稿网址：

mc03.manuscriptcentral.com/forres

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