CICC是我国唯一的国家级工业微生物菌种保藏管理中心，有近六十年菌种分类鉴定的历史，拥有先进的生物科学仪器和从事分类鉴定的专业化人员队伍，于2012年通过ISO 9001质量管理体系认证，2016年通过ISO 17025国家实验室认可，2018年通过CMA检验检测机构资质认定。CICC承担全国工业微生物菌种的委托鉴定工作，所提供的菌种鉴定与评价技术服务获得“国家工商总局（SCIC）经营许可”，为国内科研机构、大专院校和生产企业等提供微生物菌种鉴定服务，涉及细菌（放线菌）、酵母和丝状真菌等多类微生物。菌种鉴定手段包括16S rDNA、26S rDNA、ITS rDNA及持家基因等分子生物学鉴定、形态学观察、VITEK全自动微生物鉴定、API生理生化鉴定、BIOLOG碳源自动分析鉴定、MALDI-TOF MS快速鉴定、全基因组测序分析等。