部分中国鲤科(鲃亚科及野鲮亚科)的DNA条形码分析

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作者：

黄镇宇

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摘要：

鲤科(Cyprinidae)隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)辐鳍亚纲(Actinopterygii)鲤形目(Cypriniformes)鲤亚目(Cyprinoidei),广泛分布于亚欧大陆、日本、东印度群岛、非洲以及北美洲,在全球淡水捕捞业及养殖业中均占着较大比重,具有可观的经济价值。近年内,受环境污染、生境破坏和不适当的鱼类资源利用等因素影响,中国鲤科鱼类面临着低龄化、个体小型化及种群规模减少等问题,亟待相关的种质资源保护工作的开展。其中,作为鲤科的2类代表鱼类,鲃亚科(Barbinae)及野鲮亚科(Labeoninae)的部分物种种间形态相似,缺乏明显的分类特征,其物种鉴定容易发生错误。为探讨中国鲃亚科、野鲮亚科鱼类的分类地位,本研究测定了采自13省46种共计377尾样本的COI序列并结合从Genbank数据库下载的6属8种共计27条序列进行相关的DNA条形码分析,结果如下。鲃亚科在基于k2p模型的邻接树上形成31个明显分支,分支间平均遗传距离(14.20%)约为分支内平均遗传距离(0.5%)的28.40倍。其中,北江光唇鱼(Acrossocheilus beijiangensis)、侧条光唇鱼(Acrossocheilus parallens)、带光唇鱼(Acrossocheilus cinctus)、光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)、温州光唇鱼(Acrossocheilus wenchowensis)、吉首光唇鱼(Acrossocheilus jishouensis)、南方白甲鱼(Onychostoma gerlachi)、细尾白甲鱼(Onychostoma lepturum)、白甲鱼(Onychostoma simaum)、高体白甲鱼(Onychostoma alticorpus)、卵形白甲鱼(Onychostoma ovalis)、云南光唇鱼(Acrossocheilus yunnanensis)、中华倒刺鲃(Spinibarbus sinensis)、云南倒刺鲃(Spinibarbus yunnanensis)、倒刺鲃(Spinibarbus denticulatus)、鲈鲤(Percocypris pingi)、少鳞舟齿鱼(Scaphiodonichthys acanthopterus)、金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)、黑脊倒刺鲃(Spinibarbus caldwelli)、光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)、大鳞四须鲃(Barbodes vernayi)、细尾长臀鲃(Mystacoleucus lepturus)、长臀鲃(Mystacoleucus marginatus)、斑尾小鲃(Puntius sophore)、中国结鱼(Tor sinensis)、异斑小鲃(Puntius ticto)、史尼氏小鲃(Puntius snyderi)等27种鱼类均独立形成单个分支,支持其分类有效性。其余种类出现混杂分布,推测长鳍光唇鱼(Acrossocheilus longipinnis)和虹彩光唇鱼(Acrossocheilus iridescens)属同种异名,细身光唇鱼(Acrossocheilus elongatus)和细长白甲鱼(Onychostoma elongatum)属同种异名,从Genbank数据库下载的后鳍吻孔鲃(Poropuntius opisthopterus)序列和云南吻孔鲃(Poropuntius huangchuchieni)则存在以下可能:1)属于同一物种。2)属于不同物种,从Genbank下载的疏斑小鲃(Puntius paucimaculatus)序列PunpauYunN1可能隶属条纹小鲃(Puntius semifasciolatus)。此外,中国结鱼进一步分成2组,组间的遗传距离达到5.50%,高于一般物种的种内遗传距离(2%),表明其中存在隐藏的多样性。野鲮亚科在基于k2p模型的邻接树上形成了18个明显分支,分支间的平均遗传距离(12.29%)约为分支内平均遗传距离(0.29%)的42.38倍。其中卷口鱼(Ptychidio jordani)、泉水鱼(Semilabeo prochilus)、岩鲮(Semilabeo notabilis)、直口鲮(Rectoris posehensis)、巴马缨鱼(Pseudocrossocheilus bamaensis)、双珠盘鮈(Discogobio bismargaritus)、长鰾盘鮈(Discogobio macrophysallidos)、云南盘鮈(Discogobio yunnanensis)、洞庭华鲮(Bangana tungting)、华鲮(Sinilabeo rendahl)、纹唇鱼(Osteochilus salsburyi)、鲮鱼(Cirrhinus molitorella)、条纹墨头鱼(Garra fasciacauda)、印度墨头鱼(Garra salweenica)、缺须盆唇鱼(Placocheilus cryptonemus)、东方墨头鱼(Garra orientalis)均独立形成单个分支,支持其分类有效性。无须墨头鱼(Garra imberba)和墨头鱼(Garra pingi pingi)混杂在同一分支,该分支的分支内遗传距离仅为2%,推测2者为同种异名。上述各种类的聚集还有可能是杂交所致,需结合核基因测序手段进一步分析。总而言之,鲃亚科、野鲮亚科中许多种类的形态相似,DNA条形码技术可提高对鲃亚科、野鲮亚科鉴定的准确性。

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关键词：

鲃亚科；野鲮亚科；DNA条形码；细胞色素C氧化酶I；中国水系

学位级别：

硕士

DOI：

CNKI:CDMD:2.1018.888705