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2019年ISSCR上,WiCell Research Institute(下文中简称为WiCell)发表了一篇关于人多能干细胞(hPSC)质量的poster,文中强调了细胞质量对研究的重要性。低质量的细胞会影响实验结果的重现性、导致错误的实验结论、浪费时间、消耗资源。 WiCell一共收集了来自31个不同实验室的1732株iPS细胞系,截止到poster发表之日,一共有839株细胞系已经完成检测,并且这839株细胞系已被提供给了更多的科研机构和院所,但令人震惊的是,其中超过1/3的细胞株(285株细胞系)未通过WiCell的常规细胞质量测试!WiCell进行的细胞质量鉴定项目(括号内为实际检测机构),包括 ● 解冻复苏及使用光学显微镜观察的自发分化(WiCell) ● 核型检测:G-banding(WiCell) ● 均一性:使用Promega PowerPlex 16 HS System检测Short Tandem Repeat (STR) (UW‐Madison Hospitals and Clinics) ● 无菌测试(Bacteriostasis/Fungistasis):使用direct transfer method进行14天的培养(Steris) ● 支原体检测:使用Lonza Mycoalert或Biological Industries EZ PCR Mycoplasma Kit(WiCell) 如上图所示,这285株未通过细胞质量标准的原因如下: ● 61%的细胞系的核型发生改变,其中54%的核型异常原因为recurrent abnormalities,balanced translocation出现的核型异常占20%。 ● 10%的细胞系发生STR异常,包括细胞系的交叉污染、身份错配或性别错配。实际情况可能更为严重,由于某些同一性别的特定细胞系也可能被错误识别而未能检测出。 ● 超过25%的细胞系(80株以上)冻存后无法复苏,或无法进行贴壁、无法扩增或是分化区域太多。 ● 12株细胞系未通过无菌测试,1株细胞系支原体检测阳性。 由此可见,细胞质量对hPSC研究至关重要,获得高质量的hPSC是研究成功的必要条件,而在日常对hPSC进行维持培养的过程中也应选择高质量的hPSC培养基并定期对细胞进行质量监控。 影响细胞质量的因素 稳定的pH 培养环境中的刺激物(例如乳酸、活性氧、以及代谢产物的积累)会对DNA造成损伤,增加遗传信息异常的可能性。pH的变化是决定细胞培养质量的最主要因素之一,细胞外环境的pH低于7.0会降低糖酵解的速率,而如果pH低于6.9则会显着增加DNA的损伤。最近的研究表明,培养基的酸中毒可能与DNA损伤,基因组不稳定性和生长停滞增加有关。此外,实验证明,降低培养基酸度可减少细胞的凋亡。我们发现,当pH在7.2-7.4的范围内,hPSCs的培养效果最佳。STEMCELL的mTeSR™ Plus通过采用了更优化的缓冲体系,能够长时间保持培养环境pH高于7.0,确保优质的细胞培养质量。 图1. mTeSR™ Plus在Weekend-Free的方案下维持了最适宜的pH水平 使用mTeSR™ Plus在日常维持培养期间的任何时间都可以跳过2天换液,同时保持pH值高于7.0。 图2. 在mTeSR™ Plus中使用restricted换液流程(减少换液次数)维持培养的hPSCs保持正常的核型 人ES(H1)和iPS(WLS-1C)细胞在mTeSR™ Plus中培养15代。使用( A)hPSC基因检测试剂盒在p5,p10或p15(图中为p15)和(B)G-banding在p30均未检测到核型变异。 稳定的FGF2 干细胞培养的一个重要方面是维持干细胞的未分化状态,mTeSR™ Plus对培养基成分进行了多重优化,使用了更稳定的组分(包括FGF2),一次换液能够保持长达72小时的细胞稳定,而无需更换培养基。 图3. mTeSR™ Plus在Weekend-Free的方案下维持了稳定的FGF2的水平 37℃培养72h,mTeSR™ Plus中的FGF2依旧维持高水平。使用ELISA检测。 如何监测细胞质量? 明确的hPSCs克隆形态 均一的,具有确定边界,和密集的克隆是细胞高质量的指标。发亮的密集中心表示健康的克隆适宜进行传代。 多能性验证 hPSCs的多能性是将它们用于再生医学和组织工程学的关键。多能性指的是细胞分化为不同细胞类型的能力。这意味着可靠地获得、培养和维持完全多能性干细胞会对实验的结果造成了极大的影响。hPSCs向三胚层的分化潜能可通过多种方法进行评估。现有的检测方法包括畸胎瘤检测与类胚体分化,但它的实验周期长,成本高昂且不稳定。基于此,STEMCELL研发出STEMdiff™三谱系定向分化试剂盒,提供了一种简单、具重复性的方法检测新建或已建立的人ES和iPS细胞向外胚层、中胚层和内胚层分化的能力。三种谱系的分化同时进行,检测可在一周之内完成,使得多能性检测相比之前更为快速、易用且准确。 图4. STEMdiff™三谱系定向分化试剂盒检测流程 遗传学检测 如上文中WiCell数据所示,绝大部分iPS不符合细胞质量的标准是由于核型的变化。hPSCs在常规培养期间会以非随机和零星的方式获得核型异常。这些细胞遗传学变化背后的机制仍未可知。hPSCs中最常受影响的染色体包括1,8,10,12,17,18,20和X,而在人类癌症中也观察到许多这些复发性异常,带来了将这些细胞用于治疗应用的安全性问题。而由hPSCs培养不当而产生的核型异常,会极大影响实验的准确性。而STEMCELL研发的hPSC Genetic Analysis Kit(hPSC基因检测试剂盒)包括用于检测报道过的人ES和iPS细胞中大部分的核型异常的引物和探针。试剂盒基于qPCR技术研发,可高效且性价比极高的进行多种人ES和iPS细胞系的筛查,速度快,成本低且灵敏度高。如下图所示,染色体20q11.21的扩增为一种亚核型异常,因此难以被传统的核型检测手段(如G显带)检测出。而染色体20q11.21的增加导致 一些基因的拷贝数增加,包括BCL-XL,具有这些突变的hPSCs拥有强大选择性的增殖优势。 图5. hPSC基因检测试剂盒检测出染色体20q11.21变异 使用(A)hPSC基因检测试剂盒检测出iPS细胞系WLS-4D1中染色体20q重复,而(B) 使用G显带并未测出,需要通过(C)荧光原位杂交(FISH)使用针对20q11(绿色)和 20q11.21(红色)的探针证实。 相关产品 更多资源 想要了解更多关于hPSC质控的信息,可点击下图查看更多,包括如何使用hPSC基因检测试剂盒进行日常hPSC核型监测,和更多细胞系的相关数据。 (文章来源于STEMCELL ,作者Ariel) |
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