mega11进化树分析

这个比较简单，我就不细说了

2.1：打开mega11后，如果你要做进化树分析，切记，右下角选择ANALYZE 2.2 选择Edit 菜单下的Insert Sequence From File ** 2.3 Creat a new alignment 2.4 根据实际情况选择DNA或者protein，这里我们选择protein 2.5 可以把一些对的不整齐的删除掉 2.6 序列比对，选择Ailgn by ClustalW 2.7 序列比对，参数按照默认就行 2.8 导出为Mega Format，然后将当前的页面关闭 2.9 选择data菜单中的open a File/Session 2.10 总共有三种方法，分别是邻接法，最大似然法，最小进化法，这里我选择邻接法 2.11 bootstrap replicaitons设置为1000 number of threads自己根据实际情况自己设置 2.12 导出为nwk格式 2.13 2.14 另存为nwk格式