三元相图怎么看怎么画 您所在的位置:网站首页 等边三角形多少度 三元相图怎么看怎么画

三元相图怎么看怎么画

2023-09-18 03:52| 来源: 网络整理| 查看: 265

原标题:三元相图怎么看怎么画

简介:周运来,男,长大了才会遇到的帅哥,稳健,潇洒,大方,靠谱。一段生信缘,一棵技能树,一枚大型测序工厂的螺丝钉,一个随机森林中提灯觅食的津门旅客。

什么是三元相图

三元图是重心图的一种,它有三个变量,但需要三者总和为恒定值。在一个等边三角形坐标系中,图中某一点的位置代表三个变量间的比例关系。在群体遗传学中,它被称做Finetti图;在博弈论中,常被称为simplex图。

在高通量测序分析领域中,最常用的是两组间的比较,展示的方式有火山图、曼哈顿图等,而三组互相两两比较需要展示三个图吗?就没有更好的展示方式了吗?三元图的引入解决了这一问题。近年来,常用于展示三组间的相对基因表达或OTU丰度,即美观,又有意义。

三元相图怎么看

常用三角形来表示三元合金的成分,这样的三角形称为浓度三角形或成分三角形(CompositionTriangle)。常用的成分三角形是等边三角形和直角三角形以及等腰三角形。是应用最为广泛的还是等边三角形,这里也主要介绍等边三角形的三元相图。

如图所示:

oa+ob+oc=AB=BC=CA

由于oa=bC=WA

ob=Ac=WB

oc=Ba=WC

因此,可用

oa代表A组元的含量,

ob代表B组元的含量,

展开全文

oc代表C组元的含量。

所以你需要画一个等边三角形还模拟一下,需要注意的是箭头的方向,还有就是三角形是等边的很是对称,所以要把字母标好。相信我,你会乱的,然后就好了。

快速看谁多谁少 快速理解位置意义:重心图,你看目标点离那个角近,就是它在相应的组中相对比例高;反之离某个角远,其相对比例也低。 精确读三组比例

垂线法:点向三条边做垂线,穿越的格数,即对角组中所占比例;

向各边零坐标方向作平行线法:按坐标系组的颜色和数值直接读各组比例;

三元图规律 三角形边平等线上的点,在平行线对应的顶点组所占比例是恒定的。 顶点到底边直线上的点,上面任意点中两底角组相对比例恒定。 通常代表基因/OTU的相对表达/丰度,而且为了防止点过大或过小,数据通常还需要经过log2变换,将表达范围从0-1百万,转换为0-20的区间;如果是OTU的千分比,则转换为0-10的区间。 打破了普通两两比较火山图展示方式,可将三组两两比较和三组的相对关系展示在同张图中; 两组只能比较一次,三组可以比较三次,可説的结果非常多; 三是个非常好的数字,2组比较太常见且单调,4组及以上信息量大让人晕,三组正好高端大气上档次,而且还有内涵。

Software、

根据wikipedia的介绍目前有以下方法可以绘制三元相图:

Software、

根据wikipedia的介绍目前有以下方法可以绘制三元相图:

JMP Origin R packages: Ternary, which employs the native plot functions; Plot-ly, which uses a bespoke suite of plotting functions; vcd, which contains the function ternaryplot; ggtern, an extension to ggplot2. Statgraphics Veusz ternary, a python library for ternary plotting ternplot for Matlab PGFplots for LaTeX ternaryplot.com online tool for ternary plotting Ternary, which employs the native plot functions; Plot-ly, which uses a bespoke suite of plotting functions; vcd, which contains the function ternaryplot; ggtern, an extension to ggplot2.

当然,我们就介绍集中R做的三元相图。

vcd 包

图片.png

?ternaryplot # 获得示例文档。

ggtern包

喜欢(习惯)ggplot的朋友可能会更加喜欢ggtern包。它是基于ggplot2的,参数设置方面也是一致的。

如果变量较多可采用核密度估算,并使用轮廓显示结果.

Ternary

如果你想一步一步地构建一个三元相图那么Ternary也许是一个不错的选择。

#### Nextplot:###TernaryPlot('Steam', 'Ice', 'Water', grid.lines=5, grid.lty='dotted',grid.minor.lines = 1, grid.minor.lty='dotted',point='West')HorizontalGridmiddle_triangle



【本文地址】

公司简介

联系我们

今日新闻

    推荐新闻

    专题文章
      CopyRight 2018-2019 实验室设备网 版权所有