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献给初学者:western blot操作步骤2012版

2023-07-10 06:11| 来源: 网络整理| 查看: 265

四、转膜

我们实验室使用的是半干转膜电泳槽。对于转印90kd以下的蛋白,转膜液都不用加SDS,如果是蛋白分子量大的话可以加入0.037%的SDS。

1. 在电泳结束前20min开始准备转膜所需的东西。转一张膜需准备6张的滤纸(长一般为8.1~8.3cm,宽度根据裁的胶大小实际测量,但胶一般会缩水,所以裁8cm就行)和1张PVDF膜。切滤纸和膜时一定要戴干净手套,因为手上的蛋白会污染膜。PVDF膜使用前用无水甲醇中浸泡1min~2min。目的是为了活化PVDF膜上面的正电基团,使它更容易跟带负电的蛋白质结合,做小分子的蛋白转移时多加甲醇也是这个目的。

2. 将玻璃板撬开才可剥胶,撬的时候动作要轻,要在两个边上轻轻的反复撬。撬一会儿玻璃板便开始松动,直到撬去玻板(撬时一定要小心,玻板很脆弱,我用的是冰箱里附带的塑料除霜铲,效果出奇的好)。除去小玻璃板后,将浓缩胶轻轻刮去,要避免把分离胶刮破。也可取10ml注射器吸满转印缓冲液,往玻璃板与凝胶之间注水,使液体的压力将两者自然分开。取出凝胶后应注意分清上下,可以在右上角裁一个小角。之后有两种方法供选择,一是按照marker指示,把含有自己感兴趣的蛋白的胶裁下来,二是把整张胶转膜,前一种方法更加节约材料,但操作稍微麻烦了一点。在加有转移液的培养皿里放入裁好的胶、浸过甲醇的PVDF膜和滤纸,平衡10min左右,也是为了除去滤纸和转移膜中的气泡以及胶上多余的SDS。

3. 带上手套,平放转移槽的底座,依次在石墨电极上叠放3张浸泡过缓冲液的滤纸、PVDF膜(此时可在PVDF右上角减去一个角,以辨明转膜后的蛋白面与非蛋白面)、刚刚完成电泳的凝胶和另外3张浸泡过缓冲液的滤纸。用枪头或移液管在叠层的滤纸上滚动,除去气泡。注意每叠一层就要用玻璃棒或圆筒试管赶去气泡,因为一个气泡的厚度对于蛋白来说都是十万八千里的。用干净纱布将叠层上面和周围的多余缓冲液吸干(这一步很重要,宁可太干也不能太湿,太干容易烧胡,太湿的话多余的缓冲液会导致电流短路,大大降低转移效率,如果同时转好几条胶的时候更要小心,有一个胶短路就会影响整体的转移效率)。最后将转移槽的上盖扣上,接通电源开始转膜。由于设备昂贵,第一次操作应向熟手请教,否则短路可能烧坏设备!转完后立即清洗设备,特别是金属上盖,转膜液特别容易在金属上盖上形成结痂,影响设备的正常使用,我们实验室今年做western的同志因为忽略这一点,转膜仪烧坏了好几次。

4. 依据分子量大小电泳15~60min。如果初次转膜,可以根据一般经验,即多少kD的蛋白就转多少分钟,再根据结果调整时间。之后断开电源,取出转移膜进行后继实验。

5. 为了便于观察电泳效果和转膜效果,以及判断蛋白分子量大小,最好使用预染。传统方法是将膜用1×丽春红染液染5min(于脱色摇床上摇)。然后用水冲洗掉没染上的染液就可看到膜上的蛋白。实际上更常用且简便的方法是先将膜晾干,然后浸入20%的甲醇,待完全浸湿后取出透光观察即可看到蛋白条带(此方法仅仅适合PVDF膜)。将膜晾干备用。使用预染marker话可以看见marker的颜色转印到了膜上,但是凭借这个颜色来判断是否转印完全或转印过头是不可靠的。

五、免疫杂交反应

1. 将膜移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h即可。如果是自己配置的封闭液,最好过滤一下以消除固体杂质。实际经验表明与其封闭过夜,不如一抗孵育过夜,具体原因可以参考这个帖子:http://protein.dxy.cn/bbs/topic/17898080

2. 将一抗用封闭液稀释(一般用封闭液稀释即可,如果背景不高用TBST稀释也可以,当然熟练后还可以自由发挥,配制一些自己的复方稀释液)至适当浓度(可以在1.5mlEP管中配置工作液,常用稀释倍数为1:200,1:500,1:1000,具体需要预实验进行摸索,用后可回收重复用2~3次,但回收重复利用的效果如何就要看抗体的质量,分装的抗体不推荐回收。稀释后应在2-3天内使用,4度保存,避免反复冻融。);撕下适当大小的一块儿保鲜膜铺于实验台面上,四角用水浸湿以使保鲜膜保持平整;将抗体溶液加到保鲜膜上;从封闭液中取出膜,用滤纸吸去残留液后,将膜蛋白面朝下放于抗体液面上,掀动膜四角以赶出残留气泡(也可使用手术室的病理袋,质量不错,减去下面的折叠部分,用封口器(40~80元一个)封上,不漏液即可)。37°孵育1h之后转移到室温下再孵育1h(或者4°孵育过夜),用TBST在室温下脱色摇床上洗两次,每次10min;再用TBS洗一次,10min。也可以多洗几次,比如4次,每次5min。

3. 在培养皿内加入二抗稀释液(10ml足够了,一般1:1000甚至1:10000用TBST稀释),放在摇床上,室温下孵育1~2h后,用TBST在室温下脱色摇床上洗两次,每次10min;再用TBS洗一次,10min,进行化学发光反应。选择好一个合适的条件不要轻易改变,另外相比一抗,二抗作用的时间应严格控制,实践证明一抗时间长点可能没什么关系,而二抗时间若过长过短都将会直接影响结果。二抗孵育之后还要注意好好洗涤,否则显影是背景可能脏。

六、化学发光(ECL),显影,定影

1. 现在工作台上铺一张保鲜膜,将PVDF膜放在保鲜膜上。将ECL的A和B两种试剂在EP管内等体积混合(注意吸完A试剂后吸B试剂前要患枪头),然后均匀滴在PVDF膜的蛋白面,反应1~2min后,将PVDF膜上多余的ECL工作液吸干,之后转移到在X片夹中预先铺好的保鲜膜上一侧,把另一侧翻过来盖在其上。用透明胶把保鲜膜固定在片夹上。

2. 在暗室中,将1×显影液和定影液分别到入塑料盘中;在红灯下取出X-光片,用切纸刀剪裁适当大小(比膜的长和宽均需大1cm);打开X-光片夹,把X-光片放在膜上,一旦放上,便不能移动,关上X-光片夹,开始计时;根据信号的强弱适当调整曝光时间,一般为1min到2min,也可选择不同时间多次压片,以达最佳效果(也有人重叠压好几张片,固定曝光5~10分钟,从这好几张片中选出最合适的底片);曝光完成后,打开X-光片夹,取出X-光片,迅速浸入显影液中显影,待出现明显条带后,即刻终止显影。显影时间一般为1~2min(20~25℃),温度过低时(低于16℃)需适当延长显影时间;显影结束后,马上把X-光片浸入定影液中,定影时间一般为5~10min,以胶片透明为止;用自来水冲去残留的定影液后,室温下晾干(注意:显影和定影需移动胶片时,尽量拿胶片一角,手指甲不要划伤胶片,否则会对结果产生影响)。X光片一般选用柯达原装的生物实验专用柯达X-OMATBT胶片 。显影液和定影液最好每周配置一次,避光室温保存,显影和定影液是最便宜的试剂了,千万不要因为它而影响了整个结果。

七、凝胶图象分析

将胶片进行扫描或拍照,用凝胶图象处理系统分析目标带的分子量和净光密度值,比如bio-rad的Quantity One。如何使用请看这里http://protein.dxy.cn/bbs/topic/17898080。

主要参考资料:

1、WB实战指南+正确使用Quantity One定量 by jacqueslm2001 http://protein.dxy.cn/bbs/topic/17898080

2、Abcam的western新手指南 http://www.abcam.com/ps/pdf/protocols/?WB-beginner.pdf

3、土豆网的western blot视频 上海交大出品 http://www.tudou.com/programs/view/MjbxGQJ2kRU/

4、《分子克隆实验指南》精编版 化学工业出版社

5、《抗体技术实验指南》科学技术出版社

6、milipore的western blot的优化方案 http://www.dxy.cn/upload/2010/millipore/index.html

7、Western blot步步看(网络流传最广的资料) 作者不详 http://protein.dxy.cn/bbs/topic/21950829

8、Bio-rad 蛋白印迹手册 http://www.dxy.cn/bbs/thread/21360641#21360641

9、穷人的劳斯莱斯-我的五年western blot体会 by seagate http://protein.dxy.cn/bbs/thread/18102961#18102961

附:Western Blot Quick Guide(以及一天跑完Western的时间规划)

前期准备:蛋白已经定量,各样本已经稀释到某固定浓度,已经和SDS loading buffer混合,已经分装好,保存与-20°。头天下午或晚上配胶,分离胶和浓缩胶一起配好,带上梳子,放入潮湿的自封袋内放入4°冰箱备用。

8:00 从冰箱里取出蛋白样品,用PCR仪95度加热5min。混合均匀并离心。

8:30 取出昨晚配好的胶,组合,加电泳液。在电泳液里拔梳子能稍微容易一些。用10ul的枪加样。

9:00 开始电泳。恒流30mA一般1个小时足够了。

9:30 开始准备转膜用的滤纸和PVDF膜,PVDF膜泡甲醇。一般8cm的宽是固定的,所以如果要裁胶的话可以先大概估计一下。

10:10 电泳结束(假设电泳用了70分钟),起开玻璃板,裁出胶上所要的条带,如果整块胶转就更方便了。把胶放在盛有转膜缓冲液的培养皿里。

11:00 转膜开始(这里裁纸和铺三明治还是比较费时间的,我一般要用30分钟到50min,所以这里要抓紧时间)。

12:00 转膜结束(这里按60min的半干转的时间来计算)。开始封闭1h。

13:00 封闭结束,开始孵育一抗(在这里你可以选择一抗孵育过夜,如果不过夜的那一天就能结束),如果不过夜的话我一般选择37° 1h然后在室温(23°左右)再1h。

15:00 一抗孵育结束。TBST洗涤3*10min或者5*6min。

15:30 开始孵育二抗。室温1h足够了。

16:30 二抗孵育结束。TBST洗涤3*10min或者5*6min,这里推荐采用5*6min。

17:00 ECL发光,压片10min,显影1min,定影10min,那么在18:00之前你就能看到结果了,呵呵,如果结果不好还有后招,用stripping(一抗二抗洗脱液)洗涤,我用的是碧云天的碱性一抗二抗洗脱液,按照说明书来一般20min就行,然后洗涤几次,重新封闭1h,然后一抗过夜,明日在继续战斗。这样的话18:30之前也能结束战斗了。



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