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目录 二分类资料 1. 单一模型校准曲线 lrm()函数拟合的logistic模型 glm()函数拟合的logistic模型 a.Score()函数 B.val.prob()函数 2.多模型校准曲线 lrm()拟合的logistic回归 glm()拟合的logistic回归 生存资料 编辑 单模型单时点校准曲线 rms包cph()函数拟合的生存模型 survival包coxph()函数拟合的生存模型 单模型多时点校准曲线 多模型同时点校准曲线 cph()函数 coxph()函数 Calibration校准曲线:就是将实际发生率和预测发生率绘制的散点图。是对Hosmer-Lemeshow拟合优度检验的结果可视化。 基本原理: 首先利用列线图预测每位研究对象的预测值,并将其按从低到高的顺序排列,根据四分位数将队列分为4组(或者根据其他分位数分组),然后分别计算每组研究对象的预测值和相应的实际值得均值,并将两者结合起来作图得到4个校准点,最后将这4个校准点连接起来得到预测校准曲线。 二分类资料 1. 单一模型校准曲线 lrm()函数拟合的logistic模型使用rms包中的lrm()函数拟合logistic模型,然后使用calibrate()函数拟合校准曲线,并使用plot()绘图 案例:肺动脉栓塞模型 #载入数据 library(readxl) data |
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