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一维核磁氢谱1H NMR的分析与绘制图片(1)

2024-07-11 04:14| 来源: 网络整理| 查看: 265

先说点题外话

 

首先恭喜你,这位新同学,经过孤独、压抑的备考来到了我们有机化学/高分子化学课题组,希望你在未来的几年里继续保持这样的精神在科研的路上继续前行,在几年后怀着与现在同样的自信与骄傲走上人生的下一台阶。

 

当然了,老师们、师兄师姐们应该也已经告诉你,科研不易,每一个好看的数据、精美的图表背后都是数日、数周甚至数月、数年的辛苦努力,希望你在将来面对难以解决的科学问题与迷茫、无助的情绪时,可以不怕尝试,不怕失败,即使前路满是荆棘也充满斗志的走下去。

 

这个专栏记录了我在研究生期间学习到的各种技能与曾遇见的各种问题,我希望其中的内容可以帮助正处于无助中的你。需要注意的是,其中的许多内容都是非常主观的、基于我经验的,大家在阅读的时候请务必灵活理解,根据你的需要进行运用;许多基本的电脑与软件操作默认大家都会,相关教学视频可以在B站找到,前人们已经做过许多介绍,我不再班门弄斧。来往的大神们也请大家多多提出意见,这里借用一句笔吧评测室的话:交流发刊心得,帮助科研小白,谢谢大家!

 

以下是正文

 

分析氢谱是有机化学、高分子化学学生们的入学第一课与必备技能,这篇文章将详细介绍如何利用软件MestReNova进行核磁氢谱图的处理、绘制、美化与其他的一些使用技巧。

 

核磁氢谱的测试结果是以一个文件夹的形式保存的,其中一个名称为fid的、数百KB大小的文件便是即为测试结果原始数据,将其拖入MestReNova软件工作区便可打开。如下图,打开了一个PEG衍生物在氘代氯仿中的核磁图。

 

图1 导入fid文件后的程序。

第一步,打开处理选项卡,进行相位校正与基线校正

图2 相位校正与基线。

点击相位校正—自动:有时候。核磁仪器测出的结果中会在一些峰的左右出现基线的明显偏移,使用相位校正功能即可解决这个问题。

点击基线—自全动:同样的,核磁氢谱的基线也会有“上下波动”的情况,使用基线可以调平。

许多特别关注出峰积分的同学应该已经注意到了,基线与相位的平滑、正确与否对积分的计算具有明显的明显,因此需要结合这两个软件功能才能测得一个比较准确的结果。注意,相位不正确时调节基线是无效的,因此务必先调节相位。

 

图3 同一个谱图在相位校正与基线校正前后的对比。注意右图中因为已经校正相位,因此基线校正的效果不明显。

 

第二步,打开分析—参考—参考选项卡,进行某一峰的化学位移定义

分析化学相关的课程里已经解释过,核磁氢谱中的化学位移的值是一个相对的值。用于核磁测试的氘代试剂中加入了四甲基硅TMS作为内标,其上甲基的化学位移被定义为0,测试的分子上的氢原子的化学位移值根据与TMS上氢的区别而确定。许多化学反应的前后变化仅会有某处氢峰发生位移,比如2-溴乙酸变为2-叠氮乙酸,需要根据出峰位置判断反应是否完全进行,因此需要这一功能处理谱图以防止仪器误差造成的判断错误。此外,当测试的分子中包含TBDMS等基团时,测试软件可能会将该类基团上的Si-CH3峰的化学位移当成为0,为了作图的严谨,同样需要对真正的TMS峰进行矫正。当然,这里所说的峰不仅仅单指TMS上的氢峰,也可以用于定义氘代氯仿(7.26),氘代DMSO(2.54)或者测试物质上的某个氢峰。

 

具体方法是,打开分析—参考—参考选项卡,此时移动光标,软件会自动将光标对准到峰的最高点处并显示此处的化学位移;点击这个最高点,出现一个新的窗口,在新的化学位移一栏输入你希望的值并点击OK按钮即可。

图4 寻找出峰位置。图5 光标自动对准某个峰的最高点处并以红色线条表记该峰,此图中标记的峰为TMS图6 为峰输入一个新的化学位移。



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