MPI常用命令

1.mpd & 启动本机的mpi守护进程

2. mpdboot:  

杀死所有的mpd守护进程。 

6.mpdtrace：查看MPI环境中的机器 

11. 编译命令

mpicc:  MPI程序编译命令。  常用参数： -g  加入调试信息。 mpiCC/mpicc/mpif77/mpif90 mpiCC编译并联接用C++编写的MPI程序 而mpicc是编译并联接用C编写的MPI程序 mpif77和mpif90分别编译并联接用FORTRAN77和Fortran90编写的MPI程序

这些命令在联接时可以自动提供MPI需要的库 并提供特定的开关选项 

注意mpiCC不能不能用于编译C程序 常用的编译选项是       -mpilog    产生MPE的log文件       -mpitrace 产生跟踪文件 这样在该MPI程序执行时会打印出其运行踪迹信息，但是它和-mpilog 在编译时不能同时存在 只能二者选一       -mpianim 产生实时动画       -show     显示编译时产生的命令 但并不执行它       -help      给出帮助信息       -echo     显示出当前正在编译联接的命令信息 此外它们还可以使用一般的C++/C/FORTRAN77/Fortran90通用的选项，含义和原来的编译器相同

To compile a single file foo.c, use    mpicc -c foo.c To link the output and make an executable, use    mpicc -o foo foo.o Combining compilation and linking in a single command    mpicc -o foo foo.c 最简单的MPI运行命令是 mpirun –np N program program是可执行MPI程序名 以这种方式进行执行 其中N是同时运行的进程的个数 需要首先对可用的机器进行配置 配置文件是$(HOME)/mpich/util/machines/machines.LINUX 在这个文件中 每一行写上可用的机器名 比如 tp5.cs.tsinghua.edu.cn tp1.cs.tsinghua.edu.cn tp2.cs.tsinghua.edu.cn tp3.cs.tsinghua.edu.cn tp4.cs.tsinghua.edu.cn 83 tp8.cs.tsinghua.edu.cn

这样就有6台机器可供MPI使用 使用这种方式启动时 可执行程序必须放在不同机 同帐户的相同路径下 比如在tp5.cs.tsinghua.edu.cn上$(HOME)/mpich/examples/basic/下 mpirun –np 6 cpi 则需要在{tp1,tp2,tp3,tp4,tp8}上的$(HOME)/mpich/examples/basic/下都有该cpi程序 如果不使用缺省的配置文件 则需要在命令行给出配置文件 该配置文件的 mashines.LINUX相同 比如 mpirun –machinefile hosts –np 6 cpi 只需在hosts中给出可使用的机器名字即可 还有一种更为灵活的配置方式 它允许可执行程序有不同的名字 有不同的路径 启动方式是 mpirun –p4pg pgfile cpi 它的配置文件pgfile的格式如图 38所示                                                          图 38 配置文件的通用格式 需要多少机器 就写几行 注意在这种启动格式中 不需要指出启动多少个进程 进 配置文件指定 一种可能的格式如图 39所示 tp5   0   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi tp1   1   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi tp2   1   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi tp3   1   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi tp4   1   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi tp8   1   /home/pact/mpich/examples/basic/cpi 图 39 配置文件示例 注意第一行的0并不表示在tp5上没有进程 这里0特指在tp5上启动MPI程序的执行 mpirun是MPI程序的启动脚本 它可以简化作业的启动程序 并且尽可能把不同特征屏蔽掉 提供给用户一个通用的MPI并行机的概念 MPI程序的一般启动方式是 mpirun -np 一般MPI会自动决定使用什么样的设备和什么样的结构 若MPI无法决定 则可以通过选择开关指定 可用的设备选项有           chameleon (包括chameleon/pvm, chameleon/p4, ...)           meiko     (使用meiko设备)           paragon   (paragon上的ch_nx设备)           p4        (工作站机群上的ch_p4设备)           ibmspx    (IBM SP2上的ch_eui)           anlspx    (ANLs SPx上的ch_eui)           ksr       (KSR 1和2上的ch_p4)           sgi_mp    (SGI多处理器上的ch_shmem)           cray_t3d (Cray T3D上的t3d)           smp       (SMPs上的ch_shmem)           execer    (一个定制脚本，目前还不稳定) 对于MPI无法识别的选项 它将抛弃 完整的MPI运行方式为 mpirun [mpirun_options...] [options...] 在${MPIR_HOME}/util/machines下有对应的       -arch 指明结构信息 machines. 文件       -h 帮助信息       -machine use startup procedure for       -machinefile 列出可选的机器       -np 指出运行需要的处理器个数       -nolocal 不在本地机运行       -stdin filename 用给定的文件名作为标准输入 只显示执行的命令 而不实际运行它       -t 用于测试       -v 尽可能显示详细的信息       -dbx 在dbx下启动第一个进程       -gdb 在gdb下启动第一个进程       -xxgdb 在xxgdb下启动第一个进程       -tv 在totalview上启动 针对NEC - CENJU-3的特殊选项有       -batch作为批处理作业执行       -stdout filename 用指定的文件名作为输出       -stderr filename 用指定的文件名作为标准输出 针对Nexus设备的特殊选项有 并且使-np -nolocal无效 自动选       -nexuspg filename用给定的文件作为配置文件 择 -leave_pg       -nexusdb filename 使用Nexus给定的资源数据库 针对工作站机群的特殊选项有       -e 用execer来启动程序 而不是execer       -pg 用配置文件来启动一个p4程序       -leave_pg 运行结束后不删除P4配置文件       -p4pg filename用指定的进程组配置文件而不是临时创建一个 使得-np和-nolocal无效 自动选择 -leave_pg       -tcppg filename使用指定的tcp进程组配置文件而不是临时创建一个使得-np和- nolocal无效 自动选择 -leave_pg       -p4ssport num 使用p4安全服务程序来启动该程序 该服务器使用的端口号为 num 如果num=0 则使用环境变量MPI_P4SSPORT的值 该服务器可以加速进程的启动 如果设置了MPI_USEP4SSPORT和MPI_P4SSPORT的值 其效果就如同-p4ssport 0 针对批处理环境的特殊选项       -mvhome 将可执行程序移到home路径下       -mvback files 将指定的文件移到当前路径下       -maxtime min 以分钟为单位的最大运行时间       -nopoll 不使用查询模式进行通信       -mem value 每个结点需要的内存       -cpu time 硬件CPU约束时间 针对IBM SP2的特殊选项 -cac name 指定ANL 调度期 针对Intel Paragon的特殊选项       -paragontype name 选择递交作业的方式       -paragonname name 指定运行作业的远程shells的名字       -paragonpn name 在Paragon上运行部分的名字 异构系统上的运行 通过指定多个-arch -np 参数对 可以在不同的结构上协同运行一个MPI程序 比如利用 本地机sun4和另一个机器rs6000同时执行一个程序 在sun4上启动2个进程 在rs6000上启动 则启动命令为 3个进程     mpirun -arch sun4 -np 2 -arch rs6000 -np 3 program 如果不同机器上的程序名字不同 比如sun4上的程序名字是program.sun4 rs6000上的 机器名字是program.rs6000 则可以用%a代替机器名     mpirun -arch sun4 -np 2 -arch rs6000 -np 3 program.%a 比如分别存放在 如果执行程序的存放路径也不相同 /tmp/me/sun4 和 /tmp/me/rs6000下 则启动命令为 mpirun -arch sun4 -np 2 -arch rs6000 -np 3 /tmp/me/%a/program

其它可执行命令 mpiman 启动MPI的手册帮助程序 它提供两种显示方式 一种是UNIX的man方式 一种是通过 缺省情况下 mpiman使用xman, 即X窗口系统的手册帮助浏览器来阅 Web的HTML格式 读各个帮助页面 其它的开关选项是       -xmosaic 指定使用xmosaic Web浏览器       -mosaic 指定使用mosaic Web浏览器       -netscape 指定使用netscape Web浏览器       -xman   指定使用X窗口系统的xman手册浏览器       -man    指定使用man program (比如mpiman -man MPI_Send) mpireconfig

根据模板文件产生make文件 它可以根据特定MPICH的配置 将模板中的变量替换为 合适的参数形成所需要的make文件 命令格式是 mpireconfig filename filename 是将要产生的文件名 但是相应的filename.in文件必须是已经存在了的