66号指令

66号指令（英文：Order 66），又称66号克隆人协议（英文：Clone Protocol 66），是用于控制克隆人士兵的一项绝密指令。该指令发布后，克隆人士兵大脑内的控制芯片会被激活，并促使他们按照预先编写的程序将绝地武士视为叛徒。

克隆人士兵控制芯片植入的最初目的是为了避免他们不受绝地将军的指挥，但培育士兵的卡米诺科学家认为战争期间可能有一部分绝地武士会产生动摇，因此专门设计了该指令以作为一种应急手段。但实际上，66号指令却被西斯利用，成为埋藏在大共和国军中的一个后门程序。

在克隆人战争期间，无论是绝地武士，还是克隆人士兵都对66号指令及控制芯片的存在一无所知，直到CT-5385“锤头”的芯片发生故障，使66号指令被提前激活，直接造成了绝地将军蒂普拉的死亡。这一连串的事件使克隆人士兵CT-5555“老五”产生了怀疑，并私下里展开调查。尽管对幕后黑手的实际身份一无所知，但“老五”还是查明了66号指令的作用，而且一路顺藤摸瓜，查到了最高议长希夫·帕尔帕廷身上，然而遗憾的是，“老五”在试图揭发这一切时却被科洛桑卫戍部队击毙。“老五”去世后，66号指令的幕后真相随着他的死而被一同掩盖，但也有一部分克隆人士兵开始产生疑虑，认为控制芯片的用途不正，他们暗中接受手术，移除了控制芯片——这其中就包括CT-7567“雷克斯”、CC-3636“沃尔夫”和CC-5576-39“格雷戈”。

克隆人战争末期，尽管绝地委员会对最高议长的行为充满担忧，但自始至终都没有什么主动的作为，直到19 BBY时，帕尔帕廷的真实身份——西斯黑暗尊主达斯·西迪厄斯曝光，绝地委员会才决定对他进行逮捕。然而，帕尔帕廷却利用这一契机诬指武士团意图谋反，并向克隆人士兵下达了66号指令，处决了指挥各部队的绝地武士。在这次大清洗发生后不久，极少部分绝地幸存者——如绝地大师尤达和欧比-旺·克诺比等都分别潜伏于银河系各地，开始流亡生涯。

當時身為銀河共和國參議院議長的白卜庭為了成功取得政權及肅清西斯教派的千年仇敵——絕地武士，策劃一連串的陰謀，待時機成熟後便展開屠殺計划。

白卜庭（達斯·西帝）最初指使新徒弟安納金‧天行者（黑武士）帶領複製人501軍團進攻絕地聖殿，自己則向在戰場上的複製人士兵下令殺死正在前線作戰的絕地武士。安納金不論是絕地大師還是幼小學徒，都毫無留情地全數殺害。但複製人501軍團指揮官艾普卻在追殺絕地學徒途中,被光劍砍中而死。另外在前線作戰的絕地武士也都大多被殺，尤達感到身邊的複製人將要殺自己，所以先下手殺了準備殺自己的複製人士兵；歐比王·肯諾比因剛剛離開了複製人士兵，複製人士兵不能近距離槍殺，要用大炮，但炮彈差一點就擊中歐比王，歐比王只是因為砲撃的衝擊力而從高處掉入水中，沒有生命危險；其他絕地武士也大多數陣亡。

最後只有歐比王·肯諾比和尤達兩位絕地武士生還（在非正傳的傳說（Legends）系列故事與遊戲中則提到不止這兩位絕地武士生還），二人會合後先前往絕地聖殿修改絕地信息，要其他生還者不要前往絕地聖殿而是要保護自己躲起來。二人在消滅聖殿中的複製人士兵並修改信息後，在保安紀錄中看到白卜庭是西斯大帝、安納金屠殺絕地幼徒與武徒以及安納金拜師於他的事情。尤達決定自己前往消滅白卜庭，而歐比王要前往消滅安納金。歐比王起先拒絕，並要求改為去對付白卜庭，但尤達對他說安納金已成為西斯武士的事實只好答應。歐比王猜想出佩咪的孩子父親是安納金，故前往拜訪佩咪說出安納金已投身西斯及其在絕地聖殿中的屠殺，在佩咪前往安納金所在之地時歐比王藏身在飛船之上，安納金故而以為佩咪背叛自已而幾乎殺了她。歐比王在決鬥中斬下了安納金的左手及雙腳，但卻沒有殺了他，只拿走了光劍；尤達和白卜庭在會議大堂中對戰，二人受傷不分勝負，尤達自行退卻而白卜庭則因感到安納金有危險而前往貿易聯邦秘密總部。尤達和歐比王會合，決定暫時穩居以靜候時機來臨，二人後來分別隱居沙漠行星塔圖因和沼澤行星達哥巴。