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ASA全基因组芯片

2024-05-28 07:56| 来源: 网络整理| 查看: 265

ASA全基因组芯片

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ASA-750K芯片——更适合中国人队列研究

ASA(Asian Screening Array)芯片是 Illumina 一款基于9000+东亚人全基因组测序数据设计的全基因组 SNP 芯片, 该芯片包含70万个标记,是对东亚地区的低频突变体(MAF 为 1%~5%)覆盖度较好的芯片;诺禾在此基础上新增了5万个特有的标记。

位点信息

基因组骨架(550K):9000+亚洲人15~30× 全基因组测序数据;疾病/性状相关位点。 临床研究位点(100K):常见疾病、HLA、药物基因组相关等。 探索性研究(50K):非临床相关基因的外显子区域。 样本指控(10K):血型判断、性别。 定制位点(50K):疾病相关位点;性染色体位点。

应用方向

队列研究

疾病与风险因素、遗传特征等研究

癌症疾病

肿瘤、免疫病、肥胖、代谢疾病等研究。寻找差异SNP位点。

药物基因组学研究

研究基因变异所致的不同疾病对药物的不同反应

诺禾优势

1.专业背景强

基于成熟的生物信息分析人才,进行专业的项目分析。

2.科学方案设计

从材料选取、探针捕获、到检测分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

DNA样本准备

DNA片段化

iScan检测

数据分析

信息分析

诺禾致源WGBS基于全基因组水平,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准定位,快速准确找到差异位点,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。 产品 分析内容 ASA 全基因组芯片 1.样本各位点分型结果 2.样本检出率、性别判断

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样本类型 送样建议 新鲜人组织 ≧30mg;口腔拭子≧3份 核酸DNA 总量≧500ng,浓度≥10 ng/μl 新鲜细胞数量 1×106 -1×107个 全血 ≥0.5mL 唾液 ≥4 mL

常见问题

1. ASA 全基因组芯片比较适合哪些研究项目?

(1)疾病研究:利用 ASA 全基因组芯片进行 GWAS 研究,从基因层面解析复杂疾病。 (2)药物基因组学研究:研究基因变异所致的不同疾病对药物的不同反应。 (3)临床科学研究:筛查遗传病、肿瘤、罕见病等。 (4)追溯祖源:查找祖源信息并利用祖源区分易感基因、研究遗传性疾病等。

2. ASA 芯片与同类型芯片相比,其优势是什么?

芯片 ASA GSA Zhonghua-8 检测位点数 750K 660K 880K 样本/芯片 24 24 8 测序平台 iScan iScan iScan 通量 4608样本/周 4608样本/周 4608样本/周 低频覆盖度 24% (MAF 1~5%) MAF>1% 65% (MAF>1%) 适用人群 东亚人 全球人 中国人

3. ASA全基因组芯片送样量和周期

送样量:DNA浓度>30 ng/μL,体积>30 μL。 周期:15个自然日/1000个样本。

拓展材料

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专属东亚人的ASA芯片

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