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分子生物学名词解释

2023-04-14 23:56| 来源: 网络整理| 查看: 265

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1、. helix: 螺旋,蛋白质中一种螺旋形的二级结构。-amanitin:鹅膏蕈碱,一种能不同程度地抑制三种真核生物RNA聚合酶的毒素。-galactosidase:-半乳糖苷酶,将乳糖分解为半乳糖和葡萄糖的酶。 sheet:折叠,蛋白质的一种二级结构,相对平坦,在两条平行的或反向平行的肽段之间形成氢键。 subunit:亚基,原核生物RNA聚合酶全酶的组成成分。在启动子识别中需要。-dependent termination:依赖型终止,原核生物中的一种转录终止方式,依赖于蛋白和DNA/RNA序列引起转录终止。10 box:10框,大肠杆菌中常见的启动子元件。由于它位于转录起始为点上游约10

2、个碱基处而得名。3g5 exonuclease activity:3g5外切核酸酶活性,DNA聚合酶的活性。允许在聚合反应后以3g5方向去除不正确的核苷酸。30nm fiber:30nm纤维,一种染色质的高级结构。其延长的结构宽度大约是30nm。30S initiation complex:30S起始复合体,是原核生物中由mRNA、30S核糖体亚基和起始tRNA在起始密码子位置组成的复合体。35 box:35框,大肠杆菌中常见的启动子元件。由于它位于转录起始为点上游约35个碱基处而得名。5g3 exonuclease activity:5g3外切核酸酶活性,原核生物中DNA聚合酶I的一种功能。

3、允许以DNA合成方向去除核苷酸。常在去除RNA引物中使用。5-bromouracil (BU):5-溴尿嘧啶(BU),具有诱变性的碱基类似物。与胸腺嘧啶相似,但很容易转换成与鸟嘌呤配对的互变异构形式。带有溴基团的结构与尿嘧啶相似。A (aminoacyl) site:A(氨酰基)位,带有新氨基酸的tRNA与核糖体结合的第一个位置。AgI editing:AgI编辑,真核生物中对mRNA进行转录后修饰的一种形式,修饰时将腺嘌呤脱氨基形成次黄苷,次黄苷是一种非普通碱基。Acetylation:乙酰化作用,将一个乙酰基加到某个分子上的过程。Aconitase:顺乌头酸酶,调控铁代谢的蛋白质。分别控制

4、运铁蛋白和铁蛋白的稳定性和可转译性。Activators:激活蛋白,促进基因转录的蛋白质。Active site:活性位点,酶分子中直接负责催化反应的位点。Affinity chromatography:亲和层析,柱层析技术的一种。柱中用能与一组特殊的蛋白质结合的分子填充。Alkyl group:烷基,由碳和氢组成的一类化学基团。Alleles:等位基因,相同基因的不同版本,它们之间在功能和序列上稍有不同。Allosteric regulation:别构调节,调节的一种形式,通过一个小分子结合到蛋白质的调节位点而引起其活性位点结构和功能的改变。Alternative polyadenylati

5、on:可变聚腺苷酸化,通过改变前体mRNA的切割位点和聚腺苷酸化位点而从一个编码区产生不同大小mRNA的能力。能改变蛋白质分子的大小和mRNA的性质(如稳定性)。Alternative splicing:可变剪接,通过选择包含或不包含某些内含子和外显子而从一个编码区产生不同蛋白质的能力。Ames test:埃姆斯测验法,用来评价化学物质是否具有潜在诱变性的技术。Amino acids:氨基酸,能聚合形成蛋白质的小分子。名称来自于它们所带的氨基以及酸性的羧基。Amino group:氨基,由氮原子与两个氢原子结合形成的化学基团。Aminoacyl-tRNA synthetase:氨酰-tRNA合

6、成酶,一种将tRNA与正确的氨基酸匹配的蛋白质。名称来源:酶合成了将氨基酸连接到tRNA上去的酰基。Anticodon:反密码子,tRNA上能与一个或多个密码子结合的三碱基序列。Anti-parallel:反向平行的,两条平行但方向相反的链。常用来描述DNA分子中的链相对于各自的方向。Ara operon:ara操纵子,含有阿拉伯糖代谢基因的操纵子。Attenuation:衰减作用,trp操纵子中用于确保当色氨酸存在时基因不被转录的一种机理。Attenuator:衰减子,紧接在trp操纵子的启动子之后转录出来的序列,对衰减作用机理很重要。能形成终止型发夹结构而使在操纵子进行的转录停止。AU-r

7、ich element (ARE):富含AU元件(ARE),在调节mRNA稳定性中起作用的一些真核生物mRNA 3UTR序列。因序列中含有许多A和U而得名。Autonomously replicating sequence (ARS):自主复制序列(ARS),酵母中的一种复制起点。名称来源:含有此序列的DNA片段即使不是染色体的一部分也能够自主地进行复制。Basal transcription:基础转录。真核生物中如果只有前起始复合体存在(没有激活蛋白)的情况下所发生的低速率的转录。Base analogues:碱基类似物,结构上与DNA碱基类似的分子,能被整合到DNA中。Base excis

8、ion repair (BER):碱基切除修复(BER),DNA损伤修复途径,通常用来修复DNA碱基的普通损伤。Base pair:碱基对,通过氢键结合在一起的互补的核苷酸。常用来度量DNA的长度。Base-stacking:碱基堆积,用来描述DNA分子中碱基排布位置的术语。碱基对一个接一个地平放在平行的平面上,产生一种它们是堆放在那里的印象。Beads-on-a-string:线珠结构,用于描述DNA组织最低一级水平的术语。核小体由裸露的DNA片段连接在一起。Bi-directional replication:双向复制,用来描述DNA复制从复制起点开始沿两个相反的方向进行的术语。Branc

9、h migration:分支迁移,指Holliday交叉的移动,它会引起同源染色体不同区段之间发生杂交。CgU editing:CgU编辑,一种形式的真核生物转录后修饰作用,修饰时将胞嘧啶脱氨基形成尿嘧啶。Capping:加帽,将鸟嘌呤核苷的衍生物加到前体mRNA 5端上去的转录后修饰作用。Carboxyl group:羧基,一个碳原子连接到两个氧原子上形成的酸性化学基团。Catabolite activator protein (CAP):代谢物激活蛋白(CAP),原核生物中对葡萄糖/cAMP浓度进行响应而激活转录的蛋白质。用于增强lac和ara操纵子基因的转录,产生的蛋白在分解代谢中起作用

10、。Chaperones:伴侣蛋白,帮助其它蛋白质折叠成正确结构的蛋白质。Chromatin immunoprecipitation (ChIP): 染色质免疫沉淀法(ChIP), 一种免疫共沉淀技术,用于检查特异DNA序列与特异蛋白质之间的结合。Chromatin remodeling proteins: 染色质重塑蛋白, 改变组蛋白与DNA之间结合方式的蛋白质,是一种调控转录的方式。Clamp loader: 滑行夹加载器, 由真核生物DNA聚合酶的一部分亚基组成的将滑行夹套到DNA上去的装置。Co-immunoprecipitation (CoIP): 免疫共沉淀法(CoIP), 一种检查

11、某种蛋白质是否与其它蛋白质或其它分子结合的技术。蛋白质的免疫沉淀采用抗体进行。任何与该蛋白结合的蛋白质也将被沉淀和鉴定出来。Colonies: 集落, 平板上分开的细胞群体。理论上说,一个集落中的所有细胞是完全相同的,因为它们都是一个细胞的后代。Column chromatography: 柱层析, 使蛋白质穿过层析柱而对它们进行纯化的一套综合技术。蛋白质的性质和层析柱的性质决定了蛋白质流出柱子的不同时间。Complementary: 互补的, 用来描述能互相配对的碱基的术语。Conformation: 构象, 作为结构的同义词在与蛋白质有关的表述中使用。Consensus sequence:

12、 共有序列, 一个序列元件的最有可能出现的序列。在日常英语中,consensus指每个人都同意某件事。Conservative replication: 保留复制, 一种复制模型,认为复制产生一个全新的DNA分子,而亲本DNA分子保持不变。Conservative transposition: 保守型转座, 一种转座类型,转座时转座子从它的原始位置离开并插入到一个新的位置中。Constitutive: 组成型的, 是生物学常用词,表示总是或不停的。组成型lac操纵子突变体在任何条件下都一直转录lac操纵子基因。Coordinate regulation: 协同调控, 一组基因在一起进行调控的转

13、录调控方式。Core histones: 核心组蛋白, 在一起形成核小体核心的组蛋白。Co-repressor: 辅阻遏物, 结合到阻遏蛋白上使其产生阻遏活性的小分子。Coupled transcription-translation: 偶联转录-转译作用, 当转录还在进行的时候发生的转译作用。Covalent bond: 共价键, 两个原子共享电子形成的键。Crossing-over: 交换, DNA区域在同源染色体之间发生交换的重组事件。Cross-linking: 交联, 在DNA分子中位于相对链上的碱基之间形成的共价连接。C-terminus: C末端, 多肽上含有羧基的末端。Deam

14、ination: 脱氨基, 从一个碱基上去除一个氨基的过程。在这里, Deletion: 缺失, 从DNA分子中去除碱基对的过程。Denaturation: 变性, 大分子中非共价相互作用力的破坏导致三维结构改变的过程。对DNA来说,变性涉及单链的分离。对蛋白质来说,变性涉及多肽链的解折叠。Density ultracentrifugation: 密度超速离心, 应用离心(快速旋转)根据密度对分子进行分离的技术。在此技术中,离心速度是非常非常快的。Deoxyribonucleases (DNase): 脱氧核糖核酸酶(DNase), 切割脱氧核糖核酸(DNA)的酶。Deoxyribonucle

15、ic acid (DNA): 脱氧核糖核酸(DNA), 由脱氧核糖核苷酸聚合而来的核酸。Deoxyribonucleotides: 脱氧核糖核苷酸, 与核糖核苷酸类似的核苷酸,但它们缺少OH基团。Depurination: 脱嘌呤, 从DNA骨架上去除嘌呤碱基的过程。Dideoxy method: 双脱氧法, 依赖于使用双脱氧核糖核苷酸进行DNA序列测定的技术。Dideoxyribonucleotides: 双脱氧核糖核苷酸, 与核糖核苷酸类似的核苷酸,但它们缺少两个OH基团。Dimer: 二聚体, 由两个较小的分子组成的分子。乳糖就是一个二聚体的实例,它是由葡萄糖和半乳糖组成的。由两个亚基组

16、成的蛋白质也可称为二聚体。Diploid: 二倍体, 每个基因有两个拷贝的生物。Direct repeats: 同向重复序列, 完全相同并以相同方向出现的序列。Dispersive replication: 散乱型复制, 一种复制模型,认为亲本DNA成短片段状。这些DNA片段被分散,子代DNA分子是由这些片段与新合成的片段连接而成的。Disulfide bond: 二硫键, 在两个半胱氨酸的R基团(SH)之间形成的共价键。D-loop: D-环, 联会之后的同源重组过程中形成的结构。一条染色体上的两条DNA链被分开,形成一个环状开口。DNA gyrase: DNA旋转酶, 原核生物中一种常见的

17、拓扑异构酶。通过将染色体的一部分相对另一部分进行旋转(gyrating)而消除超螺旋。DNA microarray: DNA芯片, 用来试验两种不同条件下几千个基因不同转录情况的一种技术。DNA芯片就是一块被放上了一个很小的DNA阵列的很小的玻璃片。DNA mismatch: DNA错配, 指DNA分子中两个或多个碱基没有互相正确匹配。DNA polymerase I:DNA聚合酶I,一种原核生物的DNA聚合酶,具有特殊的5g3外切核酸酶活性,可用于去除引物。DNA polymerase III:DNA聚合酶III,一种原核生物的DNA聚合酶,具有很强的持续合成能力,执行大多数DNA的复制任务

18、。DNA polymerase III core:DNA聚合酶III核心, DNA聚合酶III的最少亚基组合,能产生DNA。DNA polymerase III holoenzyme: DNA聚合酶III全酶, DNA聚合酶III的完整亚基组合。是持续进行复制所必需的。DNA strand: DNA链,脱氧核糖核苷酸以共价键连接起来的链。双螺旋由两条DNA链组成。DnaA:在大肠杆菌DNA复制起始中起作用的一种蛋白质。在OriC的位置与DNA的9-mer部分结合。Double helix:双螺旋,DNA的一种结构,由两条链组成,两条链结合在一起产生螺旋形。Double-stranded bre

19、ak repair (DSBR):双链断裂修复(DSBR),修复DNA中双链断裂的常用术语。Downstream promoter element (DPE):下游启动子元件(DPE),出现在转录起始位点下游的启动子元件。E (exit) site:E(退出)位,核糖体上的位点,是tRNA在退出核糖体之前所在的位置。Electron microscope:电子显微镜,应用电子束对亚细胞成分进行成像的显微镜。Elongation factors:延伸因子, 在转译延伸阶段发挥作用的蛋白质。Endonuclease: 内切核酸酶, 在分子的内部切割DNA或RNA的酶(与在分子的末端切割相反)。En

20、hancers: 增强子,具有调控作用的DNA元件,激活蛋白结合上去后可以增强转录速率。Enzymes:酶,催化反应的蛋白质。Ethylmethane sulfonate (EMS):乙基甲磺酸(EMS),一种烷化剂,能将一个乙基(烷基的一种)加到目标分子上。Euchromatin:常染色质,比异染色质包装松散并含有已转录基因的染色质区域。Excision repair:切除修复,受损碱基修复机理的通用名称。在切除修复中,受损的碱基(以及一些邻近碱基)被从DNA中去除并重新合成。Exons:外显子,基因中被表达(expressed)成蛋白质的部分。由内含子打断编码区域而形成。Exonuclea

21、ses:外切核酸酶,从分子的末端降解DNA或RNA的酶;换句话说,是从外面(exterior)进行切割。Exosome:外来体,一种含有外切核酸酶、以3g5方向降解mRNA的蛋白质复合体。Ferritin:铁蛋白, 在细胞质中与铁结合的蛋白质。Five prime end: 五一撇末端,DNA链的一个末端,以脱氧核糖核苷酸中核糖的五一撇(5)碳(上面连接着磷酸)结尾。一撇在这儿没有含义;它只是简单地表示五这一记号来自于对核糖上碳的人为编号。Forward genetics:正向遗传学,一种遗传学/分子生物学研究,研究中先考虑表型、之后再分离相关的基因。Frameshift:移码,一种引起mRN

22、A读码框位置发生变化的突变。由插入和缺失引起。Fusion protein:融合蛋白, 通过融合两个或多个不同蛋白产生的蛋白质。Gel electrophoresis:凝胶电泳, 根据长度将DNA分离的技术。由于DNA上带有电荷,它们在电压作用下被牵引着在凝胶中移动。Gel-filtration chromatography: 凝胶过滤层析,一种根据分子大小分离蛋白质的柱层析。采用珠状凝胶,凝胶中带有小的通道,小分子比大分子更容易被通道捕捉。Gene conversion:基因转换,同源重组的后果,在不同等位基因之间的杂交使其中的一个等位基因被转换成了另一个等位基因。这是由错配修复引起的。Ge

23、ne expression:基因表达,从基因产生蛋白质的过程。在基因表达中,细胞从基因持有的信息中产生某种物质。Genetic material:遗传物质,用来描述可以将性状在世代间传递的物质的常用术语。该术语主要在过去使用,即在DNA被发现是遗传物质之前。Global control:全局控制, 细胞中一次就对所有转译过程进行的调控。Group I introns: I类内含子,自我剪接型内含子,在剪接过程中使用鸟苷酸。Group II introns:II类内含子,自我剪接型内含子,剪接过程几乎与有剪接体参与的剪接反应相同。Guide RNAs (gRNAs):指导RNA(gRNA),在锥

24、虫中指导mRNA编辑的RNA。指导向mRNA添加或从中删去尿嘧啶Hairpin loop:发夹环, 一种RNA结构,由RNA邻近区域之间杂交产生。看起来有些像发夹。Helicase: 解旋酶,通过打断两条链之间的氢键而将双螺旋的两条链分开的酶。Helix-loop-helix (HLH):螺旋-环-螺旋(HLH),蛋白质的一种DNA结合域。该结合域的每一半由两个-螺旋通过一个肽环连接在一起。该结合域的两半通常来自于不同蛋白,它们会聚集到目标DNA位置并发生结合。Helix-turn-helix (HTH):螺旋-转角-螺旋(HTH),原核生物中常见的DNA结合基序。由两个-螺旋通过一个肽转角连

25、接在一起。Heterochromatin:异染色质,与蛋白质紧密包装在一起的DNA区域,通常没有需要表达的基因。Heterodimerization:异源二聚化作用,两个不同亚基之间形成二聚体的过程。Heteroduplex joint:异源双链接头,染色体上由同源重组产生的位点,其中来自一条染色体的DNA区域与来自另一条染色体的区域相遇。在接头处,来自不同染色体的单链DNA杂交在一起。Histone code:组蛋白密码, 在组蛋白上发生的共价修饰组合,具有功能意义,能被蛋白质识别。Histone tails: 组蛋白尾,从核小体中伸出的组蛋白非结构化长末端。能与其它DNA和其它组蛋白结合,

26、能被共价修饰。Histones:组蛋白,用于缠绕DNA以组织DNA并调控转录的蛋白质。Holliday junctions:Holliday交叉,在同源重组中一条染色体的单链与另一条染色体的单链连接形成的结构。根据科学家的名字Holliday命名。Homeodomain:同源异形域, DNA结合域,在许多真核生物中发现,在生物发育中起作用。Homologous chromosomes: 同源染色体,不是完全相同但具有同样一套基因的染色体。前缀homo- = 相同的。Homologous recombination:同源重组,在具有相似DNA序列的DNA分子之间发生的重组。前缀homo- = 相

27、同的。Housekeeping genes:持家基因,在所有细胞中必须被转录的基因,因为它们具有的功能对细胞生存来说是最基本的。持家基因是那些需要在细胞中执行日常事务的基因。Hybridization:杂交, 核酸的两条链之间的结合。杂交可以发生在两条不同的DNA分子之间,以及DNA和RNA之间。Hydrogen bonds: 氢键,相对较弱的原子之间形成的键,由于氢原子上带有部分正电荷而引起。Hydrophobic interaction:疏水相互作用,当非极性分子被置于水中发生的相互作用。Immunoprecipitation:免疫沉淀法,通过抗体对蛋白质进行分离的技术。该技术产生一种蛋白

28、质聚集形成的沉淀。Induced mutations:诱导突变, 由通常不是细胞的正常成分引起的突变。Induced-fit: 诱导契合,在催化过程中酶的活性位点结构所发生的改变。Inducer:诱导物,与转录因子结合从而激活转录的小分子。可以通过防止阻遏蛋白对转录的阻遏而发挥作用。Initiator tRNA:起始tRNA,在转译起始中起作用的一种特殊tRNA。Initiator (Inr) promoter element:起始子(Inr)启动子元件, 在转录起始中起作用的真核启动子元件。Inosine: 次黄苷,一种含氮碱基。有时出现在tRNA的反密码子中,具有识别位于密码子第三个位置的

29、三个不同碱基的能力。Insertion sequences:插入序列,简单的原核生物转座子。它们是一些能使自身插入到一段DNA随机位置中的序列。Insertion/deletion loop (IDL):插入/缺失环(IDL),在DNA复制过程中由于链滑动而形成的环。能导致缺失或插入突变,依环出现在哪条链而定。Insertions:插入,指在DNA编码区增加了碱基。Integrase:整合酶, LTR反转录转座子编码的蛋白质,与转座酶功能相似。帮助将转座子整合(integrate)到DNA的位点中。Intercalating agents: 嵌入剂,结构与碱基对相似并能插入到DNA的碱基对之间

30、的分子,能引起插入与缺失突变。Internal ribosome entry sequence (IRES):内部核糖体进入序列(IRES),真核mRNA序列中位于正常起始密码子下游、允许核糖体开始转译的区域。Intrinsic termination:内在型终止,原核生物转录终止的一种机理,终止时转录出来的RNA形成发夹环结构,紧接其后的是一连串A。称之为内在型的原因是因为RNA自身即能终止转录,不需要蛋白质的帮助。Introns:内含子, 不编码蛋白质并干涉或打断编码区的序列。Introns-early theory: 内含子早期论,认为内含子在早期生命形式中即存在并被真核生物保留而被原核

31、生物丢失的理论。Introns-late theory:内含子后期论,认为内含子是真核生物在与原核生物进化谱系分开以后才开始有的理论。Inversion:倒位,一个染色体区域的方向发生旋转或颠倒的现象。Inverted repeats:反向重复序列,on-exchange chromatography: 离子交换层析,根据蛋白质所带电荷的不同而进行分离的一种柱层析技术。层析柱用离子装填。Ionic bonds:离子键,带相反电荷的两个离子之间的引力。Kinases:激酶,将磷酸基团加到其它蛋白质上去的蛋白质。Knockdown: 基因敲低, 应用RNA干涉从细胞中去除特殊mRNA的技术。在口头

32、英语中,knock down的意思是:把······丢到地上。Knockout: 基因敲除, 将某个特殊的基因从整个生物中去除的技术。在口头英语中,knockout的意思是:某人被打败。Lac operon: lac操纵子, 含有乳糖(代谢基因的操纵子。Lac repressor: lac阻遏蛋白,调控lac操纵子的阻遏蛋白。Lactose:乳糖,一种由葡萄糖和半乳糖组成的糖。牛奶中常见。Lactose permease:乳糖渗透酶, 一种将乳糖送进细胞的蛋白质。也就是说,它使细胞对乳糖变成可渗透的。Lagging strand: 后

33、随链,在DNA复制中以不连续方式复制的链。相对于先导链的复制而言,后随链的合成稍微有一点慢而且不那么直接。Lariat:套索,在剪接中产生的环状中间结构。Leading strand:先导链,在DNA复制中连续复制的链。实际上,先导链比后随链复制得稍微快一点而且也更直接。Leaky mutation:渗漏突变, 对蛋白质功能有影响的一种错义点突变。具有渗漏突变的蛋白质也是被轻微损坏的。Leucine zipper: 亮氨酸拉链,一种由两个螺旋组成的DNA结合域形式,通常由一起来到目标DNA的两种不同蛋白质组成。两个螺旋通过疏水相互作用而保持在一起,因为两者都具有排布成一条线的亮氨酸。Ligan

34、d:配体,一种与蛋白质结合并改变蛋白质功能的小分子。Ligase:连接酶,一种修补DNA单链缺口的酶。Lock-and-key mechanism:锁-钥机理,LTR-retrotransposons:LTR反转录转座子, 一类使用整合酶将自身整合进DNA的反转录转座子。反转录转座子使用反转录酶从RNA产生DNA。这与中心法则的正常顺序相反。Macromolecule: 大分子,将小分子以共价键连接起来产生大的分子。Major grooves:大沟,双螺旋侧面的沟槽。这些沟槽有的大、有的小。大的沟槽叫做大沟。Mass spectrometry:质谱,一种应用仪器测定分子质量的技术。Methyl

35、transferase:甲基转移酶, 从一个损伤碱基上将甲基转移到自己身上的一种酶,能直接逆转损伤碱基的状态。MicroRNA (miRNA): 微小RNA(miRNA),调控mRNA稳定性及其转译的发夹形小RNA分子。前缀micro- = 很小。Mismatch repair (MMR):错配修复(MMR),一种修复DNA分子中错配碱基的机理。Mismatched base:错配碱基,一种两个碱基互相不互补的碱基对。错配碱基是被不正确地放到一起的碱基,通常由DNA聚合酶引起。Missense mutation:错义突变, 引起蛋白质中一个氨基酸变化的点突变。Modules: 模块, 在许多蛋

36、白质中存在并且在进化中相当保守的蛋白质域。Molecular cloning: 分子克隆, 一种分离基因并获得许多它的拷贝的技术。Monomer: 单体,连接在一起产生更大的分子或聚合体的小分子。Motif:基序,在许多不同蛋白质中存在的小的、基本的蛋白质结构。mRNA:信使RNA的缩写。是用来从DNA中拷贝遗传信息供核糖体使用的一种RNA。换句话说,它作为遗传信息的信使。mRNA-specific control:mRNA特异性控制,Mutation:突变, 使DNA发生可遗传变化的DNA损伤。Negative regulation: 负调控,关于转录,意思是当一种蛋白质结合上去以后引起转录

37、的阻遏。Nitrogenous base:含氮碱基,一种一个环或两个环的分子,是核酸的重要组成部分。每个环有几个氮原子。Nitrous acid:亚硝酸,能引起脱氨基和将几种碱基转变成异常碱基的诱变性化学物质。Non-homologous end joining (NHEJ):非同源末端连接(NHEJ), 一种双链断裂的修复形式,修复时将断头直接连接起来,不需要进行同源重组。Non-homologous recombination: 非同源重组, 互相不相似的(即不同源的)DNA区域之间的重排。Non-LTR retrotransposons: 非LTR反转录转座子,参照LTR反转录转座子。非

38、LTR反转录转座子没有长末端重复序列,采用完全不同的机理整合到DNA中。Nonsense mutation:无义突变,在基因的正常终止密码子之前产生一个终止密码子的点突变。产生终止密码子是一种严重的突变,常常导致mRNA不能被转译或产生严重损坏的蛋白质。N-terminus:N末端, 蛋白质的含有自由氨基的末端。N-来自于氨基中含有氮这一事实。Nuclear pores: 核孔,核膜上的大的蛋白质复合体,允许分子在细胞核与细胞质之间通行。Nucleic acids:核酸,一种大分子,是核苷酸的聚合物。由于它们含有磷酸二酯键,所以它们是酸性的,并且在细胞核中以很高的浓度存在。Nucleosome

39、:核小体,DNA包裹在组蛋白核心外面形成的结构。Nucleotide excision repair (NER):核苷酸切除修复(NER),一种切除修复方法,通常用来修复经受了大的或不同寻常修饰的核苷酸。Nucleotides:核苷酸,能够聚合形成核酸的小分子。Nucleus:细胞核,为大多数DNA提供停留场所的真核细胞内的隔离空间。原子的核是由质子和中子组成的小核心。Okazaki fragments:冈崎片段,在不连续合成中产生的新合成的单独DNA片段。冈崎是发现这些片段的科学家的姓名。Operator:操纵基因,原核生物中位于启动子下游的DNA元件。是转录调控蛋白的结合位点。Operon

40、s:操纵子, 一种相关基因的组织方式,其中所有基因位于一个调控区域的控制之下并且被表达成一个mRNA转录本。OriC:大肠杆菌染色体上复制的起点。Overexpression: 过量表达,一种在细胞中大量表达某种特殊蛋白的技术,其表达量超出了正常的浓度。P (petpidyl) site:P(肽基)位,核糖体上的一个位置,是tRNA从A位移出后所处的位置。在P位上,tRNA与多肽链之间的连接被打断,之后此多肽链与A位上的tRNA(+氨基酸)之间形成肽键。Partial diploids:部分二倍体,指一些特殊的生物,其体内的一些基因有额外的一套拷贝(参照二倍体)。Peptide:肽,时常用来说

41、明小多肽的术语。Peptide bond:肽键, 在多肽中连接氨基酸的键。Peptidyl transferase:肽基转移酶, 在核糖体中发挥作用的一种酶,它将P位tRNA上的多肽转移到A位的tRNA(+氨基酸)上,产生新的肽键。Phosphodiester bond:磷酸二酯键, 在核酸中连接核苷酸的键。该键含有一个磷原子和两个酯键。Photolyase:光解酶, 直接逆转嘧啶二聚体突变(通常由UV光线引起)的酶。Point mutations: 点突变,DNA中单个碱基的突变,通常造成某个碱基被另一个碱基替换。同样,点突变只发生在单个的碱基上,在整个DNA分子很小的部分上。Poly(A)

42、 polymerase:Poly(A)聚合酶,在前体mRNA的末尾加上许多腺嘌呤核苷酸以形成poly(A)尾的特殊酶。Poly(A) tail:Poly(A)尾,真核生物在转录后加在mRNA 3末端后面的许多腺嘌呤(A)核苷酸。Polycistronic mRNA:多顺反子mRNA,含有不止一个需转译基因的原核生物mRNA。Polymerase chain reaction (PCR):聚合酶链式反应(PCR),一种用来对DNA模板上特殊区域进行许多次复制的技术。链式反应 = 随时间推移变得越来越多的反应。经过每一循环的PCR,产生出的DNA量几乎以指数形式增长。Polymer:聚合物,通过连

43、接许多小分子而产生出的大分子。Polypeptide:多肽,氨基酸由肽键连接在一起形成的聚合物。Polysome:多核糖体,一种转译复合体,其中有多个核糖体同时在转译同一条mRNA。Positive regulation:正调控,关于转录,表示通过一种蛋白质的结合而激活转录。Pre-initiation complex:前起始复合体,在转录起始前一组通用转录因子II(TFIIs)和RNA聚合酶II在每个II类基因启动子位置组装产生的结构。Pre-mRNA:前体mRNA,真核mRNA的前体,已经被转录出来但还没有经过转录后修饰。Pre-replicative complex (Pre-RC):前

44、复制复合体(Pre-RC),真核生物中标明复制起点并启动转录的蛋白质复合体。常常在复制开始前好久就形成了。Primary structure:初级结构,蛋白质的氨基酸序列。称之为结构的原因也许是因为这样的序列常常足以决定该蛋白质折叠出的结构。Primary transcript:初级转录物,参照pre-mRNA。初级转录物是DNA的第一个RNA拷贝,是在任何修饰发生前的拷贝。Primase:引发酶,将引物加到DNA上去的酶。Primers:引物,短的RNA片段,与DNA杂交以便DNA聚合酶启动转录。在开始DNA合成前必须先有引物。Processivity:持续合成能力,DNA聚合酶在从模板上脱

45、落前一次能够合成的DNA量的大小。Promoter:启动子,负责与RNA聚合酶结合的DNA元件(在真核生物中还负责与通用转录因子的结合)。常常涉及转录调控。Proofread:校正,再次检查合成出的产物并更正其中错误的过程。DNA聚合酶和RNA聚合酶都具有一定的校正能力,以防止所合成的链中存在错误。Proteases:蛋白酶,切割其它蛋白质的蛋白质。Protein domain:蛋白质域,具有特殊功能的蛋白质结构中的一个区域。Pull-down assay:下拉分析, 一种与亲和层析非常相似的技术。层析柱用一种特殊蛋白充填,能与这种蛋白质直接或间接结合的蛋白质被留在了层析柱里。称为下拉是因为所

46、有与目标蛋白结合的蛋白质都从细胞提取物中被拉了出来。Purines: 嘌呤,具有两个环的含氮碱基。Pyrimidine dimer:嘧啶二聚体,一种DNA损伤形式,其中DNA链上两个相邻的嘧啶被共价连接到了一起。通常由UV光引起。Pyrimidines:嘧啶,只含有一个环的含氮碱基。Quaternary structure:四级结构,具有多个亚基的蛋白质的结构。这一结构的水平或组织比三级结构高一个等级。R group:R基团,氨基酸中一种可变的化学基团。Reading frame:读码框, 编码区中碱基以三个为一组形成的结构,以起始密码子和终止密码子为开始和结束的标志。Recombinatio

47、n:重组, 用于描述DNA片段顺序发生改变、产生DNA区域新组合过程的通用术语。Redundant:冗余的,遗传密码是冗余的,因为存在几个密码子编码同一种氨基酸的现象。Release factor:释放因子, 一种结合到终止密码子上的蛋白质,能将核糖体、tRNA和mRNA各自释放出来。Replication bubble:复制泡, 在DNA螺旋中单链分离产生的有点像环形的开口,在这儿可以发生DNA复制。Replication fork:复制叉, 单链分离产生的可以向一个方向复制DNA的位点。在复制叉处,粗的双链DNA分子被分成两条单链DNA分子。Replicative transpositio

48、n:复制型转座, 一种转座机理,其中原始的转座子被复制,转座子的拷贝被插入到一个DNA的新位点中。Restriction endonucleases:限制性内切核酸酶, 在分子内的特异序列位置切割DNA的酶(参照内切核酸酶)。这些蛋白质有时就被简单地称为限制酶。Reverse genetics:反向遗传学, 一种遗传学/分子生物学研究的形式,它先鉴定出一个基因,之后探索与这一基因相关的功能/表型。Reverse transcription:反转录, 从RNA生产DNA的过程。这是一个与转录相反的过程。Reverse transcriptase:反转录酶, 行使反转录功能的酶。Ribonucle

49、ases:核糖核酸酶, 切割核糖核酸(RNA)的酶。Ribonucleic acid (RNA):核糖核酸(RNA), 通过聚合核糖核苷酸产生的核酸。Ribonucleotides: 核糖核苷酸, 含有核糖的核苷酸。Ribosome:核糖体, 由RNA和蛋白质组成的大型大分子复合体。RNA interference (RNAi): RNA干涉(RNAi),一种应用siRNA或miRNA诱导目标mRNA降解的过程。该过程干涉了mRNA的正常稳定性。RNA polymerase:RNA聚合酶,聚合RNA链的酶。RNA polymerase core:RNA聚合酶核心,对转录而言需要的RNA聚合酶亚

50、基的最少组合。不能正确地启动转录。RNA polymerase holoenzyme:RNA聚合酶全酶,RNA聚合酶亚基的全套组合,能够在启动子的位置启动转录。rRNA直接用来生产核糖体的RNA。它不被转译。Rudder:方向舵,RNA聚合酶结构的一部分,用来确保DNA双链在转录泡中分开。RNA聚合酶方向舵的形状看起来有点像小船上的舵。SDS:十二烷基硫酸钠。一种在凝胶电泳前用来使蛋白质发生变性并用统一的电荷覆盖蛋白质的去污剂。Secondary structure:二级结构, 组成蛋白质的简单、通用的折叠结构。Self-splicing: 自我剪接,一些mRNA不需要外来因子如snRNPs的

51、帮助而能将其中的内含子剪接掉的过程。Semi-conservative replication:半保留复制,一种DNA的复制方式,产生的DNA中一条链来自于母本、另一条链是新合成的。半保留复制即保持了一部分旧的分子。Semi-discontinuous replication:半不连续复制,一种复制类型,其中一条链连续地进行复制,另一条链不连续地进行复制。在半不连续复制中,DNA的一半是不连续地复制出来的。Shine-Dalgarno sequence:SD序列,大肠杆菌中标明哪个AUG应该被用作起始密码子的共有序列。Silencers:沉默子,结合到阻遏蛋白上引起转录阻遏的具有调控作用的DN

52、A元件。Silent mutations:沉默突变,在密码子中改变了一个碱基但没有改变密码子所编码的氨基酸的点突变。因此,生产出的蛋白质没有发生改变,该突变在功能上察觉不到,或说是沉默的。Single-strand DNA binding proteins (SSBs):单链DNA结合蛋白(SSB), 在复制叉处与单链DNA结合的蛋白质,它们保护单链防止它们互相重新结合。Sliding clamp:滑行夹, RNA聚合酶III的一个亚基,能使RNA聚合酶III保持高的持续合成能力。滑行夹套住DNA,并在RNA聚合酶移动的时候沿着DNA链滑行。Small-interfering RNA (siR

53、NA):小干涉RNA(siRNA), 能产生RNA干涉作用的双链RNA小分子。snRNPs: 核小核糖核蛋白。是由RNA(核糖核酸)和蛋白质在细胞核中组成的大分子,在大多数内含子的剪接中都需要。Southern blotting:Southern印迹法,在凝胶电泳后用于鉴定特异DNA分子的技术。Western blotting:Western印迹法, 在凝胶电泳过程中用来鉴定特异蛋白的技术。Northern blotting:Northern印迹法,在凝胶电泳后对单个RNA分子进行鉴定的技术。Specific transcription factors:特异性转录因子,只在调控特殊基因的转录中

54、起作用的转录因子。Splice sites:剪接位点,表明内含子和外显子开始和结束位置的序列。Spliceosome:剪接体,各种因子的集合体,尤其是snRNPs,帮助将内含子剪接掉Spontaneous mutations:自发突变,细胞中因自然过程而产生的突变,例如碱基与水反应所引起的脱氨基。Start codon:起始密码子,标明转译起始位置的密码子。Sticky ends:粘性末端,由限制酶产生的单链突出末端。这些末端与切割产生的相同末端互补。结果,这样的两个末端可以容易地结合在一起。Stop codons:终止密码子,标明转译结束位置的密码子。Subunit:亚基,一个单独的多肽,是形成更大蛋白质的一个部分。一个亚基是蛋白质的一个部分,



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