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最近要开始学习代谢组学,先从基础知识做起,了解轮廓,再了解模块,再分析细节。
首先,概念性问题 1. 什么是代谢组学?它能干什么? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是研究生物体被扰动后(基因/环境改变),其代谢产物(内源性代谢物质)种类,数量及其变化规律的科学。 代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织 的内源性代谢物质的 代谢途径 及其所受内在或外在因素的影响 和 随时间变化的规律。 通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹 来反映某种 病理生理过程中 所发生的的一系列生物事件。
2. 研究对象与层次? 研究对象:各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(分子量组内差异的代谢物,才能反映出给药对小鼠肝脏代谢的影响。 怎么找差异代谢物呢? 数据分析过程使用模式识别技术,包括非监督(unsupervised)学习方法和有监督(supervised)学习方法,对样本进行归类,采用相应的可视化技术直观地表达出来。下图来源【许国旺-代谢组学:方法与应用】
没看懂,总体上是说只有经过这样的模式分析方法,才能可视化数据,只有谱图得出的代谢物信息没什么用,需要进一步分析, 也就是说用这种计量分析工具,通过组间的对比,帮我们把代谢物经过特定条件干预后 是 如何变化的,变化规律,性质的变化,量的变化来显现出来。这样才能在注释后找到后续有价值的值得分析分析的信息。
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