micro

1.重建后CT分析:打开DataViewer,导入目的图像后

2.选择load for 3D viewing

3.按住Ctrl调整图像2D位置,每个均统一方向（这里长按右键可以拉计量尺）。

4.储存对应方向的图，a single image为单张，dataset为数据集（要新建一个文件夹）

5.打开CTan.exe，第4步调整好位置的文件，导入文件

6.找到对应的标志位置，所对应的图

7.找到对应的图层，选上下区间（步长1mm-4mm,图层张数=区域长度/分辨率）

8.保存dataset

9.打开，刚保存的图，进行ROI画选

10.右下角，导入设置好的程序

11.画ROI可以批量进行，一个个导入第8步骤存好的文件即可（这里的Batman窗口不关）

12.跑完后，打开第8步的文件，导入ROI，因为这里的ROI是BMP格式的，所以格式要选BMP

13.检查每个ROI是否正确，保存，覆盖.roi尾缀的文件即可。

14.批量3D分析，继续第11步骤的窗口，Remove之前的画ROI程序，在Internal添加Thresholding、2D analysis 、3Danalysis；

15.（重要）设置背景参数（见步骤16），3Danalysis 里面分析内容全选；按左下角Star，就开始分析了

16.设置背景（重要），选择右上角Binary Selection，右下角；选择Toggle VOI View /FROM dataset/Automatic Thresholding; 观察图像是否仅画松质骨，

*阈值的设定，自动识别下大部分是最右的情况，可以按照步骤16做多几个样，取平均值

17.BMD计算，打开BMD标准品文件，

18.选择空白处，作为ROI

19. 选择右上角Binary Selection

得到一个空白处的Grayscale indexes

选择后，如图校准，OK后；再打开自动换算成下图（后续计算保持参数为下图）

20.选取分别0.25和0.75密度的柱子的ROI

21.分别进行计算

得到一个数据

22.选择Flie-Preferences-Histogram-Calibrate（设置一次即可）

23.后续样品只要导入，后添加ROI选择Toggle for Viewing，然后设置校准的背景值和阈值，然后FROM Dataset-BMD，右击保存即可。