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开学季 |《医学功能代谢组宝典》免费包邮送!送!送!点此跳转 倍数变化法(FC值) 01 FC值定义及筛选标准 (1)定义:根据代谢物的相对定量或绝对定量结果,计算某个代谢物在两组间表达量的差异倍数(Fold Change),简称FC值; (2)计算方式:A物质在对照组中的定量结果为1,在处理组中定量结果为3,那么此物质的FC值即为3; (3)筛选标准:默认选择FC≥2/FC≤0.5,可调整为FC≥1.5/FC≤0.8或FC≥1.2/FC≤0.67。 02 使用Excel计算FC值 ① 从结果Excel结果中复制出物质及对应的定量结果。 ② 在每一组后面插入一列,计算每组的平均值,使用Excel中平均值函数“Avg”进行计算。 ③ 对两组之间的平均值进行相除计算:例如A vs B,使用B average/A average进行相除得到的结果就是FC值。 T检验法(p值) 01 定义及筛选标准 (1)定义:又称student t检验(Student’s t test),是一种常用的假设检验方法; (2)运算规则:首先必须要有假设,我们假设某个代谢物在A组和B组中含量没有差异(H0,零假设),然后基于此假设,通过t test计算出统计量t值和其对应的p值,如果p-Value |
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