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2024-07-10 11:45| 来源: 网络整理| 查看: 265

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倍数变化法(FC值)

01

FC值定义及筛选标准

(1)定义:根据代谢物的相对定量或绝对定量结果,计算某个代谢物在两组间表达量的差异倍数(Fold Change),简称FC值;

(2)计算方式:A物质在对照组中的定量结果为1,在处理组中定量结果为3,那么此物质的FC值即为3;

(3)筛选标准:默认选择FC≥2/FC≤0.5,可调整为FC≥1.5/FC≤0.8或FC≥1.2/FC≤0.67。

02

使用Excel计算FC值

① 从结果Excel结果中复制出物质及对应的定量结果。

② 在每一组后面插入一列,计算每组的平均值,使用Excel中平均值函数“Avg”进行计算。

③ 对两组之间的平均值进行相除计算:例如A vs B,使用B average/A average进行相除得到的结果就是FC值。

T检验法(p值)

01

定义及筛选标准

(1)定义:又称student t检验(Student’s t test),是一种常用的假设检验方法;

(2)运算规则:首先必须要有假设,我们假设某个代谢物在A组和B组中含量没有差异(H0,零假设),然后基于此假设,通过t test计算出统计量t值和其对应的p值,如果p-Value



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