配图详解 12 个 WB 翻车原因 您所在的位置:网站首页 sds电泳marker弥散 配图详解 12 个 WB 翻车原因

配图详解 12 个 WB 翻车原因

2023-04-19 14:09| 来源: 网络整理| 查看: 265

经常做 western blot 的同学

通常会有一种错觉这哪里是搞科研

明明是搞「玄学」

十个 WB 七个歪八个丑九个坏

还有一个不出来

要么条带失踪

要么背景漆黑

要么杂带丛生

……

有时就算凑齐天时地利人和

也不一定能得到一组完美条带

江湖传言:一个生物学博士,要跑满 1000 板胶才有可能毕业

WB 实验本身就难

还总是牵涉进

「造假」「撤稿」「学术不端」等丑闻

使得主流期刊对 WB 数据要求越来越高

要求作者提供相关原始数据

甚至要求提供未切割的 WB 全膜条带

对于出道 29 年的大博士而言

WB 的「玄」之操作

它早就积攒了一本厚厚的攻略

【PS:由于排版字数限制,以下分享部分精华】

收获这份攻略

高灵敏度,高信噪比,更低背景……

让你的条带显露真身

跑胶是 WB 实验成败之母

提高跑胶质量的 Tips

蛋白分子量偏高或偏低

可能是胶的浓度与目的蛋白的浓度不对应,比如说 100KD 的蛋白你用 12% 的胶跑,或者说 20KD 的蛋白你用 8% 的胶跑。

蛋白质降解

蛋白质降解后很可能会在比原来位置低的地方出现主带,然后出现一些其他带,最主要的特点是所有的条带比正常的都低,并且条带模糊不清晰。

所有条带连成一片无间隔

最可能是上样量过多,其次是样品弥散(比如电泳长时间停止样品弥散)。

溴酚蓝拖尾

样品溶解不好或上样前未变性完全。

纵向的纹理

上样样品中存在不溶性颗粒。

溴酚蓝很粗

浓缩胶浓缩效果不好,可能是浓缩胶太短或者配错。

在分离胶中跑不动

Tris-Cl pH 值不对,或者忘记加 SDS。

BOSTER

#1/无背景无条带

http://www.boster.com.cn

原因分析

如果 marker 正常,其他位置没有条带,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。

解决办法

a. 目的蛋白完全无信号,但同时做的内参是正常的,那么大部分情况是一抗抗体失效或用错二抗。

b. 目的蛋白和内参均无信号,则考虑是否发光液失效。如果膜上没有 marker 则为转膜失败。

c. 如果中间出现了细微条带,可能是蛋白上样量太少,或一抗浓度过低。

经验之谈

上图展示一点信号都没有,大部分情况是因为抗体加错了。如果中间出现细微的条带,可能是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,ECL 发光液失效。

BOSTER

#2/高背景

http://www.boster.com.cn

原因分析

封闭不充分,一抗浓度过高,洗膜时间次数不够。

解决办法

降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。

a.一抗/二抗浓度配比不合适:杂带多,大概率是抗体特异性不好,也有可能抗体浓度太高,可尝试降低一抗浓度进行实验。

b.封闭液问题:配制封闭液所用的脱脂奶粉应选用无防腐剂实验专用脱脂奶粉。

c.洗膜不充分:洗膜按规定来 5min*5 次或 10min*3 次。

经验之谈

高背景是 WB 实验中最常见的问题,目的条带单一清晰,但其他地方又弥漫性较均一的背景(比较连续的)。杂带多大概率是抗体特异性不好,也有可能抗体浓度太高,可尝试降低一抗浓度进行实验。

BOSTER

#3/非特异性条带

http://www.boster.com.cn

原因分析

一抗非特异性与蛋白结合。

解决办法

更换一抗。

经验之谈

此种情况绝大多数是因为一抗不好,你无法判断哪一条是目的条带。如果实在没有更好的抗体,建议采用阴性对照和阳性对照来确定上述哪个条带是目的条带。当然也有一种很小几率的可能是一抗浓度太高引起的非特异性结合。

BOSTER

#4/条带中出现边缘规则的白圈

http://www.boster.com.cn

原因分析

a.电转中膜与胶之间存在气泡。

b.可能是转膜过程烧膜了,特别是半干转操作不当导致烧膜。

c.转膜时温度过高产生气泡。

d.印迹膜活化不佳。

解决办法

a.注意排清气泡。

b.优化实验条件或使用湿转法转膜。

c.把整个转膜装置放于 -20 度冰箱中电转。

d.确保印迹膜完全活化。

经验之谈

我们常常将电转液倒入一个盘子里,倒入的液体不宜太多或太少,建议高度与放上第一层滤纸齐平,然后往滤纸上浇点转膜液,往胶上面浇点电转液,用两只手的拇指和食指轻轻夹住 NC 膜的两侧中间,使膜成 U 型,然后将 U 型底部接触胶的中间,慢慢往两边放下膜,这样一般气泡很少。然后上层滤纸同样用 U 型的放置方法,用玻璃棒稍微贴实下,最后盖上海绵。

BOSTER

#5/出现黑点和黑斑

http://www.boster.com.cn

原因分析

a.一般出现这种情况可能是封闭液溶解不完全或封闭液存放时间太久(长菌)。

b.膜上其他部位与一抗或二抗非特异性结合。

解决办法

a.过滤封闭液或选用其他类型封闭液。

b.与其他品牌已验证过好用的抗体处理相同样本,作比较,看是否还有斑点。

经验之谈

牛奶溶解后,最好静止一下,然后轻轻吸取上层牛奶进行封闭,封闭结束后一定要洗 3 遍之后再加一抗。

BOSTER

#6/条带拖尾

http://www.boster.com.cn

原因分析

一抗浓度太高和时间太长。

解决办法

根据情况调整一抗浓度,时间也可缩短。

经验之谈

这种情况一般出现在大分子量抗体实验中,是因为一抗浓度太高,作用时间太长引起的。另外洗一抗和洗二抗千万不要偷工减漏,建议 5min*5 次,不要担心洗这么多次把抗体和蛋白洗掉了,真正的抗原抗体相结合通过这种方式是洗不掉的。

BOSTER

#7/出现非均一性背景

http://www.boster.com.cn

原因分析

膜可能在孵育或洗涤过程中干过。

解决办法

每一步的操作过程中,注意不要让膜干。

经验之谈

封闭时洗一抗洗二抗,以及发光时都应时刻注意切记蛋白面风干,一旦风干很可能会导致这个结果。

BOSTER

#8/某个条带变形

http://www.boster.com.cn

原因分析

SDS-PAGE 胶中存在气泡或某不溶性颗粒。

解决办法

配胶过程中,要注意不要使用无杂质液体。

经验之谈

很多实验室中使用的不是最新设备,比如配胶用的海绵垫,如果用了很多年,会从下面往上面漏小气泡,当气泡足够小并且胶快凝固的时候,走到中间的小气泡就停留在胶内,并会影响到后面的跑胶。另外配胶用的水,SDS,Tris 缓冲液要注意不要有杂质。

BOSTER

#9/条带不均一

http://www.boster.com.cn

原因分析

a.配置胶凝固不均一。

b.转膜问题:转膜夹子不紧,转膜滤纸或海绵由于使用消耗,滤纸及海绵变薄,海绵弹性不足。

c.一抗孵育问题:抗体孵育不充分或抗体稀释液放入过少。

解决办法

a.把胶配好,不合格的胶坚决不用。

b.及时更换转膜滤纸和海绵。

c.增大抗体稀释液用量、更换跷跷板类型的摇床将膜完全进入抗体稀释液中。

经验之谈

出现哑铃最大的可能是胶没有配好,胶凝固后不均一。如果你拔完梳子后出现上图中下面部分的情况,多半会出现哑铃状。另外还有一种可能是样品中含有太多杂质,没有离心下来,然后杂质沉积在孔的中间,蛋白自然被推挤到两边。

BOSTER

#10/最边缘条带弯曲

http://www.boster.com.cn

原因分析

电泳电流不均一,玻璃板右下侧有缺口。

解决办法

换用新的玻璃板,不使用两边的两孔。

经验之谈

一般我们使用的是 10 孔的胶,如果你上样刚好 10 个孔,那么最两头的两个孔肯定会歪曲。另外上样最好在胶的中间,这样电场均一。

BOSTER

#11/条带笑脸,marker正常

http://www.boster.com.cn

一般来说笑脸问题首先考虑电泳环节,多半是凝胶没凝固好。但上图 marker 却异常整齐,笑脸条带整齐地手拉手,这就不是凝胶问题导致的。

原因分析

a.loading buffer 失效,导致样品变性失败。

b.上样量过大或样品杂质多。

c.电压太高。

解决办法

a.更换 loading buffer。

b.超滤样品或降低上样量。

c.降低电压。

经验之谈

准备样本主要确认上样缓冲液是否为近期配置,并且要妥善保存,否则就会浪费珍贵的实验样本。一般电泳过程中恒压电泳,浓缩胶 80V,分离胶 120V,整个过程差不多需 2 个小时左右。

BOSTER

#12/曝光结果条带扭曲

http://www.boster.com.cn

原因分析

转膜问题,对于分子量稍大的蛋白,转膜时间过长,转膜装置产热过多,无法维持转膜时的低温环境,造成条带扭曲。

解决办法

建议在条件允许的情况下直接在 4℃ 中进行转膜,将冰更换为冰水混合物,及时更换转膜液并将转膜液放入 4℃ 中提前预冷。

经验之谈

对于大分子量的抗体,跑胶前可以先把样本煮一下,然后稍微离心一下,同样也可以改善这种情况。



【本文地址】

公司简介

联系我们

今日新闻

    推荐新闻

    专题文章
      CopyRight 2018-2019 实验室设备网 版权所有