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实验数据完成了,如何绘制为柱状图

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图文撰写 | 林宁老师

介    绍

实验数据完成了,如何绘制为柱状图?本文以实时荧光定量PCR(qPCR)为例讲解。qPCR是通过荧光信号对扩增进程实时检测,由于其灵敏度高、特异性强,样本的Ct值和与基因拷贝数有关,现已作为科研实验中重要的验证方法。今天,小编教大家从数据处理到图形绘制的全部过程,你可要记好哦~

软    件

使用的软件:Excel 和 GraphPad Prism;通常而言,不同版本的GraphPad Prism都可以完成此图。

GraphPad Prism软件名称图文介绍

今天使用的模拟数据是,与体细胞相比,肝细胞中X基因的相对表达量,计算统计学分析后,进行绘图。

1、打开导出的qPCR数据,从数据中选择结果,或者只导出结果。

2、选中样本列或基因列进行排序,数据—A-Z或Z-A;新建Excel或直接在打开表格中点⊕,计算数据。

3、分别计算4次(或3次)生物学重复的平均值,按照如下图中的公式计算△Ct(目的基因-内参基因),△△Ct(实验组-对照组),2^-△△Ct值(相对表达量),【其中Ct值的范围是15-35】。

4、数据处理好,打开GraphPad Prism,选择Column,粘贴Excel中整理好的3次重复实验数据,作图。

 

5、点击左侧Data1,出现如下图形样式,可选择你自己喜欢的。本文以柱状图为例。

6、生物学实验要求进行统计学分析,点击上面菜单栏中的Analyze,选择Column analyses中的t tests,选择右侧要比对的2个样本,点击确定,弹出的对话框中就会显示P value和P value summary。

 

7、画出表示差异的标识。点击左侧Data1返回柱状图页面,点击菜单栏中的Draw和Write的如下位置,在柱状图上画出——和****。

 

8、由于软件直接给出的图不好看,我们可以手动进行设置;鼠标分别双击误差线,柱子,坐标轴,更改误差线的颜色、宽度;*的颜色、大小设置;XY轴和柱状图的颜色、宽度、长度等。

9、最终图形如下(左图),你也可以改成彩色(右图)。

10、保存;做好柱状图后,点左侧列表的Data1—File—Export—选择TIF格式—1200dpi—点击OK保存。

学会了吧?很简单吧!

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本文仅限作图过程分析,不涉及软件问题。软件的下载,不属于本文所涉内容!

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