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图一:Histone H3蛋白结构。图片来源:SWISS-MODEL。Histone H3靶点介绍蛋白功能蛋白特性蛋白表达蛋白定位异构体 & 翻译后修饰WB实验贴士注意事项阳性对照结果示例关键控制点参考文献Histone H3靶点介绍蛋白功能 Histone H3是核小体的核心成分。 核小体将DNA包裹并压缩成染色质,限制了DNA接近细胞内其它细胞器,它们的功能需要DNA作为模板。 组蛋白在转录调控、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中发挥核心作用。 DNA可访问性是通过组蛋白的一系列复杂的翻译后修饰(也称为组蛋白编码)和核小体重构来调控的。 蛋白特性Histone H3是核小体的核心成分,超声处理的样品有助于富集更多的靶标蛋白,特别是核蛋白。 组蛋白通过不同的方式进行翻译后修饰,因此观察到的Histone H3的条带大小可能与预测的条带大小不一样。 Histone H3是一个分子量较小的蛋白,其预测分子量大小约为15 kDa。 蛋白表达在S期表达,在分化过程中,随着细胞分裂减慢,表达量急剧下降。 蛋白定位细胞核 图二:Histone H3的ICC实验结果图,Anti-Histone H3抗体产品(ab176842)。绿色:Histone H3,红色:Tubulin,蓝色:DAPI。 异构体 & 翻译后修饰人(P68431):15 kDa(预测) 小鼠(P84228):15 kDa(预测) 大鼠(P84245):15 kDa(预测) 甲基化(三甲基化、二甲基化和单甲基化) 乙酰化,磷酸化,泛素化,瓜氨酸化 回到顶部 WB实验贴士注意事项观察到的条带大小可能与预测大小不符。 超声破碎样品有助于富集更多靶标蛋白,从而解决无信号或弱信号现象。 阳性对照Histone H3: HeLa (Human cervix adenocarcinoma epithelial cell) 全细胞裂解液 (ab150035)。 更多阳性对照请参考我们的产品说明书推荐。 结果示例图三:WB- Anti-Histone H3 (di methyl K4)抗体产品(ab32356)。泳道1:HeLa全细胞裂解液; 泳道2:HEK-293全细胞裂解液; 泳道3:SH-SY5Y全细胞裂解液; 泳道4:C6全细胞裂解液。预测条带大小:15 kDa检测条带大小:17 kDa图四:WB- Anti-Histone H3抗体产品(ab176842)。泳道1:超声处理(Ultrasound time 3 s, 10 s interval, ultrasonic 5 ~15 times, ultrasonic power: 40 Kw) THP1全细胞裂解液,10ug。 泳道2:未超声处理THP1全细胞裂解液,10ug。关键控制点 在实验中除了需要注意常规问题外,还要特别关注以下关键控制点: 样本制备 添加足够量的复合蛋白酶抑制剂以避免靶标蛋白降解。 使用复合磷酸酶抑制剂,防止靶标蛋白被去磷酸化。 超声破碎样本,以获得更多的靶标蛋白。 整个样本制备过程尽量在冰浴进行,以防止蛋白降解。 通过Bradford分析、Lowry分析或BCA分析测定样本总蛋白浓度。 电泳 使用15%的分离胶 至少上样20μg总蛋白进行电泳。 转膜 推荐使用0.22 μm PVDF膜。 建议转膜缓冲液中含20%甲醇。 强烈建议转膜完成后使用丽春红染色,确定转膜是否成功。 回到顶部参考文献Lowe BR, Maxham LA, Hamey JJ, Wilkins MR, & Partridge JF. Histone H3 mutations: an updated view of their role in chromatin deregulation and cancer. Cancers. (2019).11, 660. doi: 10.3390/cancers11050660.Lewis, P.W., et al. Inhibition of PRC2 activity by a gain of function H3 mutation found in pediatric glioblastoma. Science (2013).340, 857–61. doi: 10.1126/science.1232245.Ching Y, Wan E, Liu JX, Chan KM. Histone H3 mutations in cancer. Curr Pharmacol Rep. 2018;4(4):292-300. doi: 10.1007/s40495-018-0141-6. |
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