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q-PCR引物设计的一个难题是:明明Tm值,GC含量比都正常,但是上机却总是P不出来。只能一次性设计很多组引物,同时进行PCR。时间,经费都浪费了。 既然我们自己设计的引物需要拼概率去做验证,那不如查找文献里已经发表过的q-PCR引物,拿来自己用,不就可以大大减少时间损耗了嘛。 今天分享一个正确率高,简单便捷的q-PCR引物设计的方式。直接从文献中找到我们目的基因的引物。 1、登录DeepBio官网: AI-Driven BioMed R&D Solution (deepbiogroup.com)在“AI实验辅助工具中”选择“核酸序列查询系统”,搜索框输入目的基因名称,点击搜索。 2、根据实验对象选择基因种属 3、进入核酸序列展示界面 上方展示基因信息,左侧选择实验类型(查找q-pcr引物则选择“gene expression”)。右侧展示发表在文献中的引物序列及引物信息。 这里选择了一篇发布在NC上的TP53的q-pcr引物序列。点击引物序列后的“+”符号即可完成序列复制,方便快捷。同时,可以看到文献信息。 为了验证引物序列的可靠性,复制文章题目,NCBI搜索原文,查看引物数据。 验证无误。到这里,大家可以放心使用引物序列了,毕竟别人都用这个序列发过NC了,可靠性没问题,这样就可以大大减少引物设计验证的时间,提高整个实验效率。 DeepBio还提供:查产品:基于文献引用量和影响因子提供可观的产品评分,帮助快速锁定可靠试验产品。 查实验:一键搜索研究领域内常用的实验方法,附带原文献链接,为科研人员提供课题设计思路。 目前DeepBio对科研用户是完全免费开放的,欢迎大家使用! |
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